Kec. Pesantren terus menunjukkan perkembangan yang positif di bidang pendidikan. Dengan jumlah sekolah yang tersebar merata di berbagai desa dan kelurahan, wilayah ini berupaya memberikan akses pendidikan yang lebih baik untuk seluruh warganya. Berbagai pilihan jenjang pendidikan tersedia, mulai dari tingkat dasar hingga menengah, guna memenuhi kebutuhan masyarakat di Kec. Pesantren.
CEMARA 10 RT 06 RW 03
LETJEN SUPRAPTO NO. 44
Jalan Raya Betet No. 168
RAYA CENTONG
PERUM CAHAYA PERMATA VII 6
WARINGIN NO. 6
KENARI 147 BENCE
TINALAN II BARU GG. SUSTER NO.24 C
PERUM TOSARI INDAH PERSADA F.09
| Nama Kelurahan | Negeri | Swasta | Akreditasi A | Akreditasi B | Akreditasi C |
|---|---|---|---|---|---|
| BURENGAN | 5 | 9 | 5 | 4 | 0 |
| TOSAREN | 3 | 11 | 3 | 7 | 0 |
| PESANTREN | 2 | 11 | 4 | 5 | 1 |
| BANARAN | 2 | 10 | 4 | 4 | 0 |
| BLABAK | 4 | 8 | 1 | 6 | 1 |
| BAWANG | 4 | 7 | 3 | 7 | 0 |
| SINGONEGARAN | 3 | 8 | 2 | 4 | 1 |
| JAMSAREN | 2 | 8 | 2 | 5 | 0 |
| PAKUNDEN | 2 | 8 | 3 | 4 | 0 |
| TINALAN | 2 | 7 | 2 | 2 | 1 |
| BANGSAL | 4 | 3 | 4 | 1 | 0 |
| KETAMI | 2 | 5 | 2 | 3 | 0 |
| TEMPUREJO | 2 | 5 | 2 | 1 | 1 |
| BETET | 2 | 2 | 1 | 2 | 0 |
| NGLETIH | 1 | 3 | 1 | 1 | 0 |
Sejumlah desa/kelurahan di Kec. Pesantren menjadi pusat pendidikan dengan jumlah sekolah yang lebih banyak dibanding wilayah lainnya.. Misalnya:
JL. MAUNI 88
Jl. Raya Kleco
Jl. Letjen Suprapto No.44
Jl. Raya Ngletih
Jl. Raya Betet
Jl Brig. Pol. Imam Bachri 123