Kec. Pesantren terus menunjukkan perkembangan yang positif di bidang pendidikan. Dengan jumlah sekolah yang tersebar merata di berbagai desa dan kelurahan, wilayah ini berupaya memberikan akses pendidikan yang lebih baik untuk seluruh warganya. Berbagai pilihan jenjang pendidikan tersedia, mulai dari tingkat dasar hingga menengah, guna memenuhi kebutuhan masyarakat di Kec. Pesantren.
CENDANA II / 6 A
Jalan Raya Ngletih 5
JL. CEMARA RT 03 RW 02
JL. MAYJEND PANJAITAN GG.II NO. 07
JL. TEMBUS KALIOMBO NO. 3-5
JL.RAYA PAGUT NO 114 RT. 17 RW. 06
JL RAYA BULUREJO 147 RT 27 RW 10
Jl. Akasia No. 36 Link. Dander RT/RW 04/01
RAYA PAGUT 114
| Nama Kelurahan | Negeri | Swasta | Akreditasi A | Akreditasi B | Akreditasi C |
|---|---|---|---|---|---|
| BURENGAN | 5 | 9 | 5 | 4 | 0 |
| TOSAREN | 3 | 11 | 3 | 7 | 0 |
| PESANTREN | 2 | 11 | 4 | 5 | 1 |
| BANARAN | 2 | 10 | 4 | 4 | 0 |
| BLABAK | 4 | 8 | 1 | 6 | 1 |
| BAWANG | 4 | 7 | 3 | 7 | 0 |
| SINGONEGARAN | 3 | 8 | 2 | 4 | 1 |
| JAMSAREN | 2 | 8 | 2 | 5 | 0 |
| PAKUNDEN | 2 | 8 | 3 | 4 | 0 |
| TINALAN | 2 | 7 | 2 | 2 | 1 |
| BANGSAL | 4 | 3 | 4 | 1 | 0 |
| KETAMI | 2 | 5 | 2 | 3 | 0 |
| TEMPUREJO | 2 | 5 | 2 | 1 | 1 |
| BETET | 2 | 2 | 1 | 2 | 0 |
| NGLETIH | 1 | 3 | 1 | 1 | 0 |
Sejumlah desa/kelurahan di Kec. Pesantren menjadi pusat pendidikan dengan jumlah sekolah yang lebih banyak dibanding wilayah lainnya.. Misalnya:
JL. MAUNI 88
Jl. Raya Kleco
Jl. Letjen Suprapto No.44
Jl. Raya Ngletih
Jl. Raya Betet
Jl Brig. Pol. Imam Bachri 123