Kec. Agats terus menunjukkan perkembangan yang positif di bidang pendidikan. Dengan jumlah sekolah yang tersebar merata di berbagai desa dan kelurahan, wilayah ini berupaya memberikan akses pendidikan yang lebih baik untuk seluruh warganya. Berbagai pilihan jenjang pendidikan tersedia, mulai dari tingkat dasar hingga menengah, guna memenuhi kebutuhan masyarakat di Kec. Agats.
Kampung Bismam
Kampung Yepem
Kampung Yufri
Jl. Dendew
Jl. Jalur Dua, Kampung Baru
Kampung Kaye
Kampung Uwus
Jl. Sekolah Kampung Yepem
Jl. Anderep
| Nama Kelurahan | Negeri | Swasta | Akreditasi A | Akreditasi B | Akreditasi C |
|---|---|---|---|---|---|
| BIS AGATS | 9 | 8 | 2 | 2 | 1 |
| BISMAM | 7 | 9 | 4 | 5 | 4 |
| MBAIT | 2 | 5 | 0 | 0 | 2 |
| KAYE | 2 | 0 | 0 | 0 | 1 |
| UWUS | 2 | 0 | 0 | 0 | 1 |
| YOMOTH | 1 | 1 | 0 | 0 | 1 |
| ASUWETSY | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| BERITEN | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 |
Sejumlah desa/kelurahan di Kec. Agats menjadi pusat pendidikan dengan jumlah sekolah yang lebih banyak dibanding wilayah lainnya.. Misalnya:
Jl. Yos Sudarso No. 1
Jln. Dendew Rt. Ii
JL. FRANS KAISIEPO
Jln. Kartini No. 11
Jl. Misi no.10
Jl. ADD, Agats