Kec. Agats terus menunjukkan perkembangan yang positif di bidang pendidikan. Dengan jumlah sekolah yang tersebar merata di berbagai desa dan kelurahan, wilayah ini berupaya memberikan akses pendidikan yang lebih baik untuk seluruh warganya. Berbagai pilihan jenjang pendidikan tersedia, mulai dari tingkat dasar hingga menengah, guna memenuhi kebutuhan masyarakat di Kec. Agats.
Jl. Dendew
Jl. Cemnes - Agats
Jl. Misi no.10
Jl. Yapis
Jl. Postel
Jl. Pendidikan
JL.BIMTANG LAUT
Jl. Frans Kaisepo
Jl. Nusantara
| Nama Kelurahan | Negeri | Swasta | Akreditasi A | Akreditasi B | Akreditasi C |
|---|---|---|---|---|---|
| BIS AGATS | 9 | 8 | 2 | 2 | 1 |
| BISMAM | 7 | 9 | 4 | 5 | 4 |
| MBAIT | 2 | 5 | 0 | 0 | 2 |
| KAYE | 2 | 0 | 0 | 0 | 1 |
| UWUS | 2 | 0 | 0 | 0 | 1 |
| YOMOTH | 1 | 1 | 0 | 0 | 1 |
| ASUWETSY | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| BERITEN | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 |
Sejumlah desa/kelurahan di Kec. Agats menjadi pusat pendidikan dengan jumlah sekolah yang lebih banyak dibanding wilayah lainnya.. Misalnya:
Jl. Yos Sudarso No. 1
Jln. Dendew Rt. Ii
JL. FRANS KAISIEPO
Jln. Kartini No. 11
Jl. Misi no.10
Jl. ADD, Agats