Kec. Prafi terus menunjukkan perkembangan yang positif di bidang pendidikan. Dengan jumlah sekolah yang tersebar merata di berbagai desa dan kelurahan, wilayah ini berupaya memberikan akses pendidikan yang lebih baik untuk seluruh warganya. Berbagai pilihan jenjang pendidikan tersedia, mulai dari tingkat dasar hingga menengah, guna memenuhi kebutuhan masyarakat di Kec. Prafi.
Jl. Rajawali, Udapi Hilir, Prafi, Manokwari
Jl.Poros KM 57 Trans Sorong-Manokwari Prafi
Jl. Poros KM 57 Trans Sorong-Manokwari Prafi
Prafi
JL. KARET KAMP. PRAFI MULYA
JL. MERPATI
Sp 03 Prafi
Jl. Rangkok
Kampung Prafi Mulya SP 1
| Nama Kelurahan | Negeri | Swasta | Akreditasi A | Akreditasi B | Akreditasi C |
|---|---|---|---|---|---|
| UDAPI HILIR | 3 | 9 | 2 | 3 | 2 |
| AIMASI/SP III AIMASI | 4 | 5 | 2 | 2 | 3 |
| PRAFI MULIA | 3 | 4 | 2 | 2 | 1 |
| DESAY | 1 | 3 | 0 | 1 | 1 |
| WASEKI INDAH | 2 | 1 | 0 | 1 | 1 |
| BOGOR | 2 | 0 | 0 | 0 | 2 |
| INGKWOISI | 0 | 2 | 0 | 0 | 1 |
| LISMAUNGU | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| SOMI | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| KALI AMIN | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| MATOA | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| UMBUI | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 |
| WASEKI | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 |
Sejumlah desa/kelurahan di Kec. Prafi menjadi pusat pendidikan dengan jumlah sekolah yang lebih banyak dibanding wilayah lainnya.. Misalnya:
Jalan Pendidikan Aimasi
Jl. Rajawali, Udapi Hilir, Prafi, Manokwari
Jl. Rangkok
JLN.DAHLIA NO.4
JL. G. WILIS AIMASI
JL. MERPATI