Kec. Komodo terus menunjukkan perkembangan yang positif di bidang pendidikan. Dengan jumlah sekolah yang tersebar merata di berbagai desa dan kelurahan, wilayah ini berupaya memberikan akses pendidikan yang lebih baik untuk seluruh warganya. Berbagai pilihan jenjang pendidikan tersedia, mulai dari tingkat dasar hingga menengah, guna memenuhi kebutuhan masyarakat di Kec. Komodo.
Merombok
Pulau Seraya
Jl. Van Bekkum - Labuan Bajo
Jln. Gabriel Gampur RT 013, RW 05
Jl. Van Bekkum, No. 01
Jl. Frans Sales Lega, No. 15, RT. 005 / RW 002, Labuan Bajo
JL. RAYMUNDUS RAMBU NO.1
Jl. Terang-Labuan Bajo/Nggorang
| Nama Kelurahan | Negeri | Swasta | Akreditasi A | Akreditasi B | Akreditasi C |
|---|---|---|---|---|---|
| WAE KELAMBU | 2 | 16 | 3 | 4 | 2 |
| BATU CERMIN | 7 | 7 | 3 | 4 | 4 |
| LABUAN BAJO | 4 | 6 | 1 | 8 | 0 |
| GOLO BILAS | 5 | 4 | 0 | 6 | 2 |
| GORON TALO | 4 | 5 | 4 | 0 | 1 |
| MACANG TANGGAR | 4 | 4 | 0 | 1 | 3 |
| NGGORANG | 4 | 4 | 0 | 2 | 6 |
| WARLOKA | 6 | 1 | 0 | 0 | 6 |
| GOLO MORI | 4 | 1 | 0 | 0 | 5 |
| PASIR PANJANG | 3 | 2 | 0 | 1 | 2 |
| COMPANG LONGGO | 3 | 1 | 0 | 3 | 0 |
| KOMODO | 3 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| PASIR PUTIH | 3 | 1 | 1 | 0 | 1 |
| GOLO PONGKOR | 0 | 3 | 1 | 1 | 0 |
| SERAYA MARANU | 2 | 1 | 0 | 1 | 0 |
| PAPA GARANG | 2 | 0 | 0 | 0 | 1 |
| TIWU NAMPAR | 1 | 1 | 0 | 1 | 1 |
| BATU TIGA | 0 | 1 | 0 | 0 | 1 |
| GOLO SEPANG | 0 | 1 | 0 | 1 | 0 |
| MBUIT | 0 | 1 | 0 | 1 | 0 |
| WATU NGGELEK | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
Sejumlah desa/kelurahan di Kec. Komodo menjadi pusat pendidikan dengan jumlah sekolah yang lebih banyak dibanding wilayah lainnya.. Misalnya:
JL. RAYMUNDUS RAMBU NO.1
COWANG DERENG
Jln. Van Beckhum
Jl. Van Bekkum, No. 01
Jl.pius Papu, Wae Mata
Cowang Dereng