Kec. Komodo terus menunjukkan perkembangan yang positif di bidang pendidikan. Dengan jumlah sekolah yang tersebar merata di berbagai desa dan kelurahan, wilayah ini berupaya memberikan akses pendidikan yang lebih baik untuk seluruh warganya. Berbagai pilihan jenjang pendidikan tersedia, mulai dari tingkat dasar hingga menengah, guna memenuhi kebutuhan masyarakat di Kec. Komodo.
Jln.Frans Nala, Labuan Bajo
Jl. Alo Tanis Labuan bajo
Jl. Soekarno-Hatta, No.35 Labuan Bajo
Jl. Puncak Waringin Labuan Bajo
Jl. Raymundus Rambu
Jl. Raymundus Rambu
Merombok
Jl. Empo Timber No. 5 Lando
Pulau Kukusan
| Nama Kelurahan | Negeri | Swasta | Akreditasi A | Akreditasi B | Akreditasi C |
|---|---|---|---|---|---|
| WAE KELAMBU | 2 | 16 | 3 | 4 | 2 |
| BATU CERMIN | 7 | 7 | 3 | 4 | 4 |
| LABUAN BAJO | 4 | 6 | 1 | 8 | 0 |
| GOLO BILAS | 5 | 4 | 0 | 6 | 2 |
| GORON TALO | 4 | 5 | 4 | 0 | 1 |
| MACANG TANGGAR | 4 | 4 | 0 | 1 | 3 |
| NGGORANG | 4 | 4 | 0 | 2 | 6 |
| WARLOKA | 6 | 1 | 0 | 0 | 6 |
| GOLO MORI | 4 | 1 | 0 | 0 | 5 |
| PASIR PANJANG | 3 | 2 | 0 | 1 | 2 |
| COMPANG LONGGO | 3 | 1 | 0 | 3 | 0 |
| KOMODO | 3 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| PASIR PUTIH | 3 | 1 | 1 | 0 | 1 |
| GOLO PONGKOR | 0 | 3 | 1 | 1 | 0 |
| SERAYA MARANU | 2 | 1 | 0 | 1 | 0 |
| PAPA GARANG | 2 | 0 | 0 | 0 | 1 |
| TIWU NAMPAR | 1 | 1 | 0 | 1 | 1 |
| BATU TIGA | 0 | 1 | 0 | 0 | 1 |
| GOLO SEPANG | 0 | 1 | 0 | 1 | 0 |
| MBUIT | 0 | 1 | 0 | 1 | 0 |
| WATU NGGELEK | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
Sejumlah desa/kelurahan di Kec. Komodo menjadi pusat pendidikan dengan jumlah sekolah yang lebih banyak dibanding wilayah lainnya.. Misalnya:
JL. RAYMUNDUS RAMBU NO.1
COWANG DERENG
Jln. Van Beckhum
Jl. Van Bekkum, No. 01
Jl.pius Papu, Wae Mata
Cowang Dereng