Kec. Sapeken terus menunjukkan perkembangan yang positif di bidang pendidikan. Dengan jumlah sekolah yang tersebar merata di berbagai desa dan kelurahan, wilayah ini berupaya memberikan akses pendidikan yang lebih baik untuk seluruh warganya. Berbagai pilihan jenjang pendidikan tersedia, mulai dari tingkat dasar hingga menengah, guna memenuhi kebutuhan masyarakat di Kec. Sapeken.
DESA SABUNTAN
Ds. Pagerungan Kecil
DESA PAGERUNGAN BESAR
DESA SADULANG
DESA SABUNTAN
Dusun Bajo
SEPANGKOR BESAR DESA SABUNTAN
DUSUN KORMA DESA PAGERUNGAN KECIL
JL. Sasampan
| Nama Kelurahan | Negeri | Swasta | Akreditasi A | Akreditasi B | Akreditasi C |
|---|---|---|---|---|---|
| SAPEKEN | 8 | 51 | 1 | 17 | 12 |
| SABUNTAN | 2 | 32 | 0 | 8 | 11 |
| SEPANJANG | 5 | 25 | 1 | 9 | 4 |
| SAKALA | 2 | 25 | 0 | 5 | 7 |
| PAGERUNGAN KECIL | 3 | 22 | 0 | 7 | 6 |
| PAGERUNGAN BESAR | 4 | 18 | 1 | 7 | 1 |
| SASIIL | 2 | 20 | 0 | 4 | 7 |
| SADULANG | 1 | 13 | 0 | 4 | 6 |
| PALIAT | 3 | 10 | 0 | 2 | 6 |
| TANJUNGKIAOK | 1 | 12 | 0 | 3 | 5 |
| DS. SAPEKEN | 0 | 2 | 0 | 0 | 0 |
| Kec. Sapeken | 0 | 1 | 0 | 0 | 1 |
Sejumlah desa/kelurahan di Kec. Sapeken menjadi pusat pendidikan dengan jumlah sekolah yang lebih banyak dibanding wilayah lainnya.. Misalnya:
Jl.raya Mercusuar 17
Jl. Raya Sapeken 25
Pagerungan Besar
JL. RAYA SAPEKEN NO.33
Jl. Bajo Raya
DESA PAGERUNGAN BESAR