Kec. Sapeken terus menunjukkan perkembangan yang positif di bidang pendidikan. Dengan jumlah sekolah yang tersebar merata di berbagai desa dan kelurahan, wilayah ini berupaya memberikan akses pendidikan yang lebih baik untuk seluruh warganya. Berbagai pilihan jenjang pendidikan tersedia, mulai dari tingkat dasar hingga menengah, guna memenuhi kebutuhan masyarakat di Kec. Sapeken.
Saseel
Saseel
Sepanjang
Jl. Mercusuar, Dusun Pelat - Sepanjang
Sepanjang
Sepanjang
Sepanjang
Ds.Saur Saibus
Dsn.Pelat Tanjung Kiaok
| Nama Kelurahan | Negeri | Swasta | Akreditasi A | Akreditasi B | Akreditasi C |
|---|---|---|---|---|---|
| SAPEKEN | 8 | 51 | 1 | 17 | 12 |
| SABUNTAN | 2 | 32 | 0 | 8 | 11 |
| SEPANJANG | 5 | 25 | 1 | 9 | 4 |
| SAKALA | 2 | 25 | 0 | 5 | 7 |
| PAGERUNGAN KECIL | 3 | 22 | 0 | 7 | 6 |
| PAGERUNGAN BESAR | 4 | 18 | 1 | 7 | 1 |
| SASIIL | 2 | 20 | 0 | 4 | 7 |
| SADULANG | 1 | 13 | 0 | 4 | 6 |
| PALIAT | 3 | 10 | 0 | 2 | 6 |
| TANJUNGKIAOK | 1 | 12 | 0 | 3 | 5 |
| DS. SAPEKEN | 0 | 2 | 0 | 0 | 0 |
| Kec. Sapeken | 0 | 1 | 0 | 0 | 1 |
Sejumlah desa/kelurahan di Kec. Sapeken menjadi pusat pendidikan dengan jumlah sekolah yang lebih banyak dibanding wilayah lainnya.. Misalnya:
Jl.raya Mercusuar 17
Jl. Raya Sapeken 25
Pagerungan Besar
JL. RAYA SAPEKEN NO.33
Jl. Bajo Raya
DESA PAGERUNGAN BESAR