Kec. Kota Sumenep terus menunjukkan perkembangan yang positif di bidang pendidikan. Dengan jumlah sekolah yang tersebar merata di berbagai desa dan kelurahan, wilayah ini berupaya memberikan akses pendidikan yang lebih baik untuk seluruh warganya. Berbagai pilihan jenjang pendidikan tersedia, mulai dari tingkat dasar hingga menengah, guna memenuhi kebutuhan masyarakat di Kec. Kota Sumenep.
Jln. Pondok Pesantren Al-Asyariyah Nong Bunter
JALAN ASTA TINGGI KEBUNAGUNG
JLN. RAYA GAPURA
JL. RAYA GAPURA - BANGKAL
JL. RAYA MANDING KEBUNAN
JL. NANGKA 511 KARANGDUAK
WIDURI II/II
DS. PANDIAN
Jl.KH Zainal Arifin1-9 Terate Pandian
| Nama Kelurahan | Negeri | Swasta | Akreditasi A | Akreditasi B | Akreditasi C |
|---|---|---|---|---|---|
| PABIAN | 7 | 22 | 9 | 9 | 2 |
| PANGARANGAN | 6 | 19 | 10 | 8 | 1 |
| PAMOLOKAN | 4 | 14 | 2 | 5 | 3 |
| KOLOR | 4 | 13 | 4 | 5 | 1 |
| PANDIAN | 4 | 12 | 5 | 7 | 1 |
| Pajagalan | 2 | 13 | 3 | 6 | 1 |
| KARANGDUAK | 2 | 10 | 1 | 2 | 1 |
| BANGSELOK | 1 | 9 | 1 | 3 | 1 |
| KEBUNAN | 2 | 8 | 0 | 5 | 2 |
| KEBUNAGUNG | 1 | 6 | 0 | 2 | 2 |
| MARENGAN DAYA | 3 | 3 | 2 | 2 | 1 |
| KEPANJIN | 1 | 4 | 1 | 1 | 1 |
| PABERASAN | 2 | 3 | 2 | 1 | 0 |
| PARSANGA | 3 | 1 | 2 | 2 | 0 |
| BANGKAL | 1 | 1 | 1 | 1 | 0 |
| Kacongan | 1 | 1 | 1 | 1 | 0 |
Sejumlah desa/kelurahan di Kec. Kota Sumenep menjadi pusat pendidikan dengan jumlah sekolah yang lebih banyak dibanding wilayah lainnya.. Misalnya:
JL. KH. WAHID HASYIM III / 11
JL. PAYUDAN TIMUR 1
Jl. Payudan Barat No. 9
Jl.Payudan Barat No 7
Jl. Yos Sudarso 215
Jl. Kartini Gg VI/04