Kec. Wonoayu terus menunjukkan perkembangan yang positif di bidang pendidikan. Dengan jumlah sekolah yang tersebar merata di berbagai desa dan kelurahan, wilayah ini berupaya memberikan akses pendidikan yang lebih baik untuk seluruh warganya. Berbagai pilihan jenjang pendidikan tersedia, mulai dari tingkat dasar hingga menengah, guna memenuhi kebutuhan masyarakat di Kec. Wonoayu.
PAGERNGUMBUK RT 06/RW 01
JL. SOPONYONO NO. 1
JL. KALI BADER
JL. KARYA INDAH NO.2
SAWOCANGKRING
JL. RAYA SEMAMBUNG
JL. RAYA SIMOANGIN-ANGIN
JL. RIAMIN
| Nama Kelurahan | Negeri | Swasta | Akreditasi A | Akreditasi B | Akreditasi C |
|---|---|---|---|---|---|
| PILANG | 2 | 11 | 1 | 6 | 1 |
| WONOAYU | 2 | 10 | 3 | 6 | 0 |
| WONOKASIAN | 2 | 8 | 4 | 1 | 2 |
| POPOH | 1 | 8 | 2 | 4 | 0 |
| SAWOCANGKRING | 1 | 8 | 2 | 1 | 2 |
| CANDINEGORO | 1 | 6 | 1 | 2 | 0 |
| JIMBARAN KULON | 1 | 6 | 1 | 3 | 1 |
| KARANGPURI | 2 | 5 | 3 | 1 | 1 |
| KETIMANG | 1 | 6 | 2 | 2 | 2 |
| PAGERNGUMBUK | 3 | 4 | 3 | 1 | 1 |
| PLAOSAN | 2 | 5 | 1 | 2 | 1 |
| SEMAMBUNG | 2 | 5 | 3 | 1 | 0 |
| SUMBEREJO | 2 | 5 | 2 | 2 | 1 |
| BECIRONGENGOR | 2 | 4 | 2 | 2 | 0 |
| PLOSO | 1 | 5 | 1 | 2 | 2 |
| TANGGUL | 1 | 5 | 1 | 3 | 0 |
| LAMBANGAN | 1 | 4 | 1 | 3 | 0 |
| MULYODADI | 1 | 4 | 1 | 2 | 0 |
| SIMO ANGIN ANGIN | 1 | 3 | 1 | 1 | 0 |
| WONOKALANG | 1 | 3 | 2 | 1 | 0 |
| JIMBARAN WETAN | 1 | 1 | 1 | 1 | 0 |
| MOJORANGAGUNG | 1 | 1 | 1 | 0 | 1 |
| SIMOKETAWANG | 1 | 1 | 1 | 1 | 0 |
Sejumlah desa/kelurahan di Kec. Wonoayu menjadi pusat pendidikan dengan jumlah sekolah yang lebih banyak dibanding wilayah lainnya.. Misalnya:
JL. RAYA PAGERNGUMBUK
Jl. Raya Semambung
Jl Becirongengor
Jl. Raya Jimbaran Kulon Rt.002 Rw. 001
Pilang
Becirongengor