Kec. Wonoayu terus menunjukkan perkembangan yang positif di bidang pendidikan. Dengan jumlah sekolah yang tersebar merata di berbagai desa dan kelurahan, wilayah ini berupaya memberikan akses pendidikan yang lebih baik untuk seluruh warganya. Berbagai pilihan jenjang pendidikan tersedia, mulai dari tingkat dasar hingga menengah, guna memenuhi kebutuhan masyarakat di Kec. Wonoayu.
PERUM TAS 3 BLOK C1 N0. 15-16
JL. RADEN WIJAYA 51
JIMBARAN KULON
JIMBARAN WETAN
KARANGPURI
KETIMANG
JL. DIPONEGORO RT 4 RW 1
MOJO DHUWUR
JL. RADEN PATAH
| Nama Kelurahan | Negeri | Swasta | Akreditasi A | Akreditasi B | Akreditasi C |
|---|---|---|---|---|---|
| PILANG | 2 | 11 | 1 | 6 | 1 |
| WONOAYU | 2 | 10 | 3 | 6 | 0 |
| WONOKASIAN | 2 | 8 | 4 | 1 | 2 |
| POPOH | 1 | 8 | 2 | 4 | 0 |
| SAWOCANGKRING | 1 | 8 | 2 | 1 | 2 |
| CANDINEGORO | 1 | 6 | 1 | 2 | 0 |
| JIMBARAN KULON | 1 | 6 | 1 | 3 | 1 |
| KARANGPURI | 2 | 5 | 3 | 1 | 1 |
| KETIMANG | 1 | 6 | 2 | 2 | 2 |
| PAGERNGUMBUK | 3 | 4 | 3 | 1 | 1 |
| PLAOSAN | 2 | 5 | 1 | 2 | 1 |
| SEMAMBUNG | 2 | 5 | 3 | 1 | 0 |
| SUMBEREJO | 2 | 5 | 2 | 2 | 1 |
| BECIRONGENGOR | 2 | 4 | 2 | 2 | 0 |
| PLOSO | 1 | 5 | 1 | 2 | 2 |
| TANGGUL | 1 | 5 | 1 | 3 | 0 |
| LAMBANGAN | 1 | 4 | 1 | 3 | 0 |
| MULYODADI | 1 | 4 | 1 | 2 | 0 |
| SIMO ANGIN ANGIN | 1 | 3 | 1 | 1 | 0 |
| WONOKALANG | 1 | 3 | 2 | 1 | 0 |
| JIMBARAN WETAN | 1 | 1 | 1 | 1 | 0 |
| MOJORANGAGUNG | 1 | 1 | 1 | 0 | 1 |
| SIMOKETAWANG | 1 | 1 | 1 | 1 | 0 |
Sejumlah desa/kelurahan di Kec. Wonoayu menjadi pusat pendidikan dengan jumlah sekolah yang lebih banyak dibanding wilayah lainnya.. Misalnya:
JL. RAYA PAGERNGUMBUK
Jl. Raya Semambung
Jl Becirongengor
Jl. Raya Jimbaran Kulon Rt.002 Rw. 001
Becirongengor
Jimbaran Wetan