Kec. Kebonagung terus menunjukkan perkembangan yang positif di bidang pendidikan. Dengan jumlah sekolah yang tersebar merata di berbagai desa dan kelurahan, wilayah ini berupaya memberikan akses pendidikan yang lebih baik untuk seluruh warganya. Berbagai pilihan jenjang pendidikan tersedia, mulai dari tingkat dasar hingga menengah, guna memenuhi kebutuhan masyarakat di Kec. Kebonagung.
Sanggrahan
Dsn. Kendal
Dusun Klepu
DESA KARANGANYAR
Dusun Sriten Rt.003 Rw.006
DUSUN KRAJAN
RT 01 RW 11 NGAREN
DUSUN TOWO
RT 2 RW 1
| Nama Kelurahan | Negeri | Swasta | Akreditasi A | Akreditasi B | Akreditasi C |
|---|---|---|---|---|---|
| GEMBUK | 2 | 15 | 0 | 10 | 0 |
| SIDOMULYO | 3 | 14 | 0 | 11 | 1 |
| KETRO | 4 | 10 | 2 | 7 | 0 |
| SANGGRAHAN | 2 | 10 | 0 | 7 | 0 |
| MANTREN | 1 | 10 | 0 | 5 | 2 |
| GAWANG | 2 | 8 | 0 | 7 | 0 |
| KLESEM | 2 | 8 | 0 | 4 | 1 |
| KARANGANYAR | 2 | 7 | 0 | 5 | 1 |
| PURWOASRI | 4 | 5 | 4 | 3 | 0 |
| PUNJUNG | 2 | 6 | 0 | 5 | 1 |
| KATIPUGAL | 2 | 5 | 0 | 4 | 0 |
| KETEPUNG | 2 | 5 | 0 | 5 | 1 |
| WORAWARI | 3 | 4 | 0 | 5 | 1 |
| PLUMBUNGAN | 1 | 5 | 0 | 3 | 1 |
| WONOGONDO | 2 | 4 | 0 | 5 | 0 |
| KARANGNONGKO | 2 | 3 | 1 | 2 | 1 |
| BANJARJO | 1 | 3 | 0 | 3 | 0 |
| KALIPELUS | 1 | 3 | 0 | 3 | 0 |
| KEBONAGUNG | 1 | 3 | 1 | 1 | 0 |
Sejumlah desa/kelurahan di Kec. Kebonagung menjadi pusat pendidikan dengan jumlah sekolah yang lebih banyak dibanding wilayah lainnya.. Misalnya:
Jl. Raya Kebonagung Pacitan
Jl. Pacitan-lorok
Dsn. Jati
Karangnongko
Jl. Raya Kebonagung
RT 01 RW 03 DUSUN JATI