Kec. Bunaken terus menunjukkan perkembangan yang positif di bidang pendidikan. Dengan jumlah sekolah yang tersebar merata di berbagai desa dan kelurahan, wilayah ini berupaya memberikan akses pendidikan yang lebih baik untuk seluruh warganya. Berbagai pilihan jenjang pendidikan tersedia, mulai dari tingkat dasar hingga menengah, guna memenuhi kebutuhan masyarakat di Kec. Bunaken.
JL. LORENG 2
JL.BAILANG RAYA NO.54
JL. RAYA MOLAS KOMPLEKS MASJID AL-AQSHA KEL. MOLAS LK. III KEC. BUNAKEN
JL. MASDJID HIDAYATULAH LINGK. V
JL. BAILANG RAYA NO.054 LING. I
JL. LORENG 2 BAILANG
JLN. BAILANG RAYA
Jl. Raya Tongkeina No. 81
Jl. Raya Molas
| Nama Kelurahan | Negeri | Swasta | Akreditasi A | Akreditasi B | Akreditasi C |
|---|---|---|---|---|---|
| BAILANG | 4 | 19 | 6 | 9 | 5 |
| PANDU | 4 | 10 | 1 | 4 | 7 |
| Molas | 1 | 8 | 0 | 4 | 2 |
| TONGKEINA | 1 | 3 | 0 | 2 | 2 |
| MERAS | 0 | 3 | 0 | 1 | 2 |
Sejumlah desa/kelurahan di Kec. Bunaken menjadi pusat pendidikan dengan jumlah sekolah yang lebih banyak dibanding wilayah lainnya.. Misalnya:
Jln. Manado - Wori
JL. BAILANG RAYA NO.054 LING. I
JLN. BAILANG RAYA
JL MERDEKA BAILANG LING V KELURAHAN BAILANG
JL. BAILANG
JLN. KUWALA BUHA LING. IV