Kec. Kontunaga terus menunjukkan perkembangan yang positif di bidang pendidikan. Dengan jumlah sekolah yang tersebar merata di berbagai desa dan kelurahan, wilayah ini berupaya memberikan akses pendidikan yang lebih baik untuk seluruh warganya. Berbagai pilihan jenjang pendidikan tersedia, mulai dari tingkat dasar hingga menengah, guna memenuhi kebutuhan masyarakat di Kec. Kontunaga.
DESA LIABALANO
DESA LOPDIDI
DESA MASALILI
DESA BUNGI
| Nama Kelurahan | Negeri | Swasta | Akreditasi A | Akreditasi B | Akreditasi C |
|---|---|---|---|---|---|
| Mabodo | 3 | 4 | 2 | 2 | 1 |
| KONTUNAGA | 3 | 2 | 0 | 3 | 2 |
| BUNGI | 1 | 2 | 0 | 1 | 0 |
| MASALILI | 2 | 1 | 0 | 1 | 2 |
| LAPODIDI | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| LIABALANO | 1 | 1 | 0 | 2 | 0 |
Sejumlah desa/kelurahan di Kec. Kontunaga menjadi pusat pendidikan dengan jumlah sekolah yang lebih banyak dibanding wilayah lainnya.. Misalnya:
JL. POROS MABODO
Jln. Poros Mabodo
Jalan Raya Kontunaga
Desa Bungi
Desa Liabalano
Desa Masalili