Kec. Kapontori terus menunjukkan perkembangan yang positif di bidang pendidikan. Dengan jumlah sekolah yang tersebar merata di berbagai desa dan kelurahan, wilayah ini berupaya memberikan akses pendidikan yang lebih baik untuk seluruh warganya. Berbagai pilihan jenjang pendidikan tersedia, mulai dari tingkat dasar hingga menengah, guna memenuhi kebutuhan masyarakat di Kec. Kapontori.
Kamelanta
Barangka
Todanga
Jln. Krakatau
Jalan Poros Kamaru
JL. POROS DESA BONEATIRO
Jln. Poros Baubau - Lasalimu
POROS BAUBAU LASALIMU
Desa Lambusango
| Nama Kelurahan | Negeri | Swasta | Akreditasi A | Akreditasi B | Akreditasi C |
|---|---|---|---|---|---|
| WAKALAMBE | 4 | 3 | 0 | 4 | 1 |
| KAMELANTA | 3 | 3 | 0 | 2 | 4 |
| WATUMOTOBE | 5 | 1 | 1 | 5 | 0 |
| BONEATIRO | 1 | 3 | 0 | 0 | 3 |
| BUKIT ASRI | 3 | 1 | 0 | 0 | 4 |
| LAMBUSANGO | 3 | 1 | 1 | 1 | 1 |
| WAKANGKA | 3 | 1 | 0 | 2 | 1 |
| WAMBULU | 4 | 0 | 0 | 3 | 1 |
| BARANGKA | 3 | 0 | 0 | 2 | 1 |
| LAMBUSANGO TIMUR | 1 | 2 | 1 | 0 | 0 |
| TODANGA | 2 | 1 | 0 | 2 | 1 |
| TUANGILA | 2 | 1 | 0 | 0 | 3 |
| TUMADA | 3 | 0 | 0 | 1 | 2 |
| BONEATIRO BARAT | 2 | 0 | 0 | 1 | 1 |
| MABULUGO | 1 | 1 | 0 | 0 | 2 |
| WAKULI | 1 | 1 | 0 | 1 | 1 |
| WAONDO WOLIO | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 |
| WAONDOWOLIO | 0 | 1 | 0 | 0 | 1 |
Sejumlah desa/kelurahan di Kec. Kapontori menjadi pusat pendidikan dengan jumlah sekolah yang lebih banyak dibanding wilayah lainnya.. Misalnya:
Jl. Poros Kapontori , Mataompana
LAMBUSANGO
WATAMBO
JL. LETJEN HERTASNING
JL. POROS KAPONTORI
Kapontori