Kec. Batu Atas terus menunjukkan perkembangan yang positif di bidang pendidikan. Dengan jumlah sekolah yang tersebar merata di berbagai desa dan kelurahan, wilayah ini berupaya memberikan akses pendidikan yang lebih baik untuk seluruh warganya. Berbagai pilihan jenjang pendidikan tersedia, mulai dari tingkat dasar hingga menengah, guna memenuhi kebutuhan masyarakat di Kec. Batu Atas.
Dusun Lamee
Dusun Sipa Ampa
Dusun Asaa
Dusun 3 Asaa
Jalan Poros Peropa
Dusun Gu
Dusun Wabide Jaya
Dusun I Tadu
Dusun Asaa
| Nama Kelurahan | Negeri | Swasta | Akreditasi A | Akreditasi B | Akreditasi C |
|---|---|---|---|---|---|
| BATUATAS TIMUR | 3 | 5 | 0 | 3 | 4 |
| TADUASA | 2 | 6 | 0 | 0 | 2 |
| BATUATAS BARAT | 3 | 1 | 0 | 2 | 2 |
| BATUATAS LIWU | 1 | 3 | 0 | 1 | 2 |
| WACUALA | 1 | 3 | 0 | 2 | 0 |
| TOLANDO JAYA | 1 | 2 | 0 | 0 | 2 |
| BATU ATAS LIWU | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| WAMBONGI | 0 | 1 | 0 | 0 | 1 |
Sejumlah desa/kelurahan di Kec. Batu Atas menjadi pusat pendidikan dengan jumlah sekolah yang lebih banyak dibanding wilayah lainnya.. Misalnya:
Jln. Poros Batuatas Timur
Jl. Poros Wacuala-Taduasa
Batuatas
Wambongi
DUSUN BURANGASI
Dusun Wabide Jaya