Kec. Bontomatene terus menunjukkan perkembangan yang positif di bidang pendidikan. Dengan jumlah sekolah yang tersebar merata di berbagai desa dan kelurahan, wilayah ini berupaya memberikan akses pendidikan yang lebih baik untuk seluruh warganya. Berbagai pilihan jenjang pendidikan tersedia, mulai dari tingkat dasar hingga menengah, guna memenuhi kebutuhan masyarakat di Kec. Bontomatene.
MAHARAYYA
BATANGMATA SAPO
ONTO
TAJUIYA
PULOPASI
JLN KEBON JERUK DUSUN BORITTA
KALAROI
BENTENG PANCASILA
PENGGA
| Nama Kelurahan | Negeri | Swasta | Akreditasi A | Akreditasi B | Akreditasi C |
|---|---|---|---|---|---|
| BONTONASALUK | 6 | 1 | 0 | 7 | 0 |
| BATANGMATA | 5 | 0 | 2 | 2 | 1 |
| BONGAIYA | 3 | 2 | 0 | 4 | 1 |
| TANETE | 4 | 1 | 0 | 4 | 1 |
| KAYU BAUK | 2 | 2 | 0 | 3 | 1 |
| ONTO | 2 | 2 | 0 | 4 | 0 |
| BATANGMATA SAPO | 1 | 2 | 0 | 3 | 0 |
| MENARA INDAH | 2 | 1 | 0 | 2 | 1 |
| PAMATATA | 1 | 2 | 0 | 3 | 0 |
| BARAT LAMBONGAN | 1 | 1 | 0 | 2 | 0 |
| TAMALANREA | 1 | 1 | 0 | 2 | 0 |
| DESA TANETE | 0 | 1 | 0 | 0 | 1 |
| MAHARAYYA | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 |
Sejumlah desa/kelurahan di Kec. Bontomatene menjadi pusat pendidikan dengan jumlah sekolah yang lebih banyak dibanding wilayah lainnya.. Misalnya:
BATANGMATA
Jl. Pendidikan No. 1 Batangmata
Batangmata
Dusun Saluk