Kec. Yapen Timur terus menunjukkan perkembangan yang positif di bidang pendidikan. Dengan jumlah sekolah yang tersebar merata di berbagai desa dan kelurahan, wilayah ini berupaya memberikan akses pendidikan yang lebih baik untuk seluruh warganya. Berbagai pilihan jenjang pendidikan tersedia, mulai dari tingkat dasar hingga menengah, guna memenuhi kebutuhan masyarakat di Kec. Yapen Timur.
Kamp. Pasir Panjang
Kamp. Waiso
Kamp. Korombobi
Kampung Dawai
JL. KODECO - DAWAI
Kampung Awunawai
Jalan Pendidikan Dawai
Kampung DAWAI
Kampung Wabo
| Nama Kelurahan | Negeri | Swasta | Akreditasi A | Akreditasi B | Akreditasi C |
|---|---|---|---|---|---|
| AWUNAWAI | 3 | 3 | 0 | 0 | 3 |
| DAWAI | 2 | 3 | 1 | 0 | 2 |
| NUNSEMBAI | 3 | 1 | 0 | 1 | 2 |
| Korombobi | 0 | 2 | 0 | 1 | 0 |
| MERERUNI | 1 | 1 | 0 | 0 | 1 |
| SERE SERE | 0 | 2 | 0 | 0 | 0 |
| W A B O | 1 | 1 | 0 | 0 | 1 |
| WABOMPI | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 |
Sejumlah desa/kelurahan di Kec. Yapen Timur menjadi pusat pendidikan dengan jumlah sekolah yang lebih banyak dibanding wilayah lainnya.. Misalnya:
Jalan Pendidikan Dawai
JLN.TRANS YAPEN
Kamp. Korombobi
JL. KODECO - DAWAI
Jalan Trans Yapen - Dawai
Kamp. Mereruni