Kec. Paniai Timur terus menunjukkan perkembangan yang positif di bidang pendidikan. Dengan jumlah sekolah yang tersebar merata di berbagai desa dan kelurahan, wilayah ini berupaya memberikan akses pendidikan yang lebih baik untuk seluruh warganya. Berbagai pilihan jenjang pendidikan tersedia, mulai dari tingkat dasar hingga menengah, guna memenuhi kebutuhan masyarakat di Kec. Paniai Timur.
Uwibutu
Jln. Geketobi Degeiy, Bobaigo
Iyaitaka - Enarotali
Kopaidagi
Kopo
Jln. Mutopai No 8
Uwamani
Yimouto
Badauwo
| Nama Kelurahan | Negeri | Swasta | Akreditasi A | Akreditasi B | Akreditasi C |
|---|---|---|---|---|---|
| Enarotali | 2 | 13 | 2 | 4 | 3 |
| Madi | 3 | 4 | 0 | 1 | 2 |
| Uwamani | 1 | 6 | 0 | 1 | 2 |
| Aikai | 1 | 4 | 1 | 1 | 0 |
| Kopo | 0 | 4 | 0 | 1 | 1 |
| Obaiyoweta | 1 | 3 | 0 | 1 | 1 |
| Uwibutu | 1 | 3 | 0 | 1 | 1 |
| Badauwo | 2 | 1 | 0 | 0 | 1 |
| Darouto | 1 | 2 | 0 | 0 | 1 |
| Kopaidagi | 1 | 2 | 0 | 0 | 0 |
| Timida | 0 | 3 | 0 | 2 | 0 |
| Ipakije | 2 | 0 | 0 | 1 | 1 |
| Toko | 1 | 1 | 0 | 1 | 0 |
| Pugo Woge | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
Sejumlah desa/kelurahan di Kec. Paniai Timur menjadi pusat pendidikan dengan jumlah sekolah yang lebih banyak dibanding wilayah lainnya.. Misalnya:
JL. WATA, Enarotali
Enarotali
Jalan Mambruk - Enarotali
Jl. Dimi Mana Topida Nunudagi
JL. DRS. JUNUS TEBAI, MADI-ENAROTALI
Uwamani