Kec. Ngguti terus menunjukkan perkembangan yang positif di bidang pendidikan. Dengan jumlah sekolah yang tersebar merata di berbagai desa dan kelurahan, wilayah ini berupaya memberikan akses pendidikan yang lebih baik untuk seluruh warganya. Berbagai pilihan jenjang pendidikan tersedia, mulai dari tingkat dasar hingga menengah, guna memenuhi kebutuhan masyarakat di Kec. Ngguti.
| Nama Kelurahan | Negeri | Swasta | Akreditasi A | Akreditasi B | Akreditasi C |
|---|---|---|---|---|---|
| Nakias | 1 | 2 | 0 | 0 | 2 |
| Taga Epe | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| Yawimu | 0 | 2 | 0 | 0 | 0 |
| Po Epe | 0 | 1 | 0 | 1 | 0 |
| Salam Epe | 0 | 1 | 0 | 1 | 0 |
Sejumlah desa/kelurahan di Kec. Ngguti menjadi pusat pendidikan dengan jumlah sekolah yang lebih banyak dibanding wilayah lainnya.. Misalnya:
Po Epe
Salam Epe
Kamp MAM
SMP Persiapan Negeri Mam
Jln. Pendidikan Kampung Taga Epa
Taga Epe
