Kec. Merauke terus menunjukkan perkembangan yang positif di bidang pendidikan. Dengan jumlah sekolah yang tersebar merata di berbagai desa dan kelurahan, wilayah ini berupaya memberikan akses pendidikan yang lebih baik untuk seluruh warganya. Berbagai pilihan jenjang pendidikan tersedia, mulai dari tingkat dasar hingga menengah, guna memenuhi kebutuhan masyarakat di Kec. Merauke.
JL. MAYOR WIRATNO
JL. TMP TRIKORA Kompleks Masjid Raya
JL. MENARA LAMPU SATU
Jl. Gemahripa
Jl. Treratai No.1 Gudang Arang
Jl. Pembangunan Kampung Domba
Jl. Mangga Dua
Jl. Pembangunan
Nasem
| Nama Kelurahan | Negeri | Swasta | Akreditasi A | Akreditasi B | Akreditasi C |
|---|---|---|---|---|---|
| Rimba Jaya | 5 | 21 | 1 | 11 | 6 |
| Maro | 4 | 17 | 5 | 4 | 1 |
| Kelapa Lima | 6 | 14 | 5 | 4 | 2 |
| Samkai | 2 | 16 | 1 | 4 | 7 |
| Mandala | 3 | 13 | 5 | 7 | 1 |
| Karang Indah | 2 | 9 | 3 | 2 | 2 |
| Bambu Pemali | 2 | 6 | 1 | 2 | 1 |
| Kamundu | 1 | 5 | 0 | 3 | 1 |
| Muli | 1 | 5 | 1 | 1 | 1 |
| SERINGGU JAYA | 0 | 6 | 0 | 3 | 1 |
| Kamehedoga | 1 | 4 | 1 | 1 | 2 |
| Wasur | 3 | 1 | 0 | 0 | 1 |
| Nasem | 2 | 0 | 1 | 0 | 1 |
| Nggolar | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| Bokem | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 |
| Jati-jati | 0 | 1 | 0 | 0 | 1 |
| KELAPA V | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
Sejumlah desa/kelurahan di Kec. Merauke menjadi pusat pendidikan dengan jumlah sekolah yang lebih banyak dibanding wilayah lainnya.. Misalnya:
JL. Kamizaun - Mopah Lama
JL. BIAK MERAUKE
JL. NOWARI No 97
Jl. Brawijaya, Merauke - Papua
JL.KAMIZAUN MERAUKE
Jl. Pendidikan Merauke