Kec. Merauke terus menunjukkan perkembangan yang positif di bidang pendidikan. Dengan jumlah sekolah yang tersebar merata di berbagai desa dan kelurahan, wilayah ini berupaya memberikan akses pendidikan yang lebih baik untuk seluruh warganya. Berbagai pilihan jenjang pendidikan tersedia, mulai dari tingkat dasar hingga menengah, guna memenuhi kebutuhan masyarakat di Kec. Merauke.
Jl. Kimaam
Jalan Gudang Arang Matandi
JL. NOWARI No 97
JLN. PERTANIAN JATI - JATI MERAUKE
JL. BRAWIJAYA
JL. KIMAAM NO.4 RT 12 / RW 04
JL. Kamizaun - Mopah Lama
JL. ARAFURA NO. 2
JL. SMK YPK
| Nama Kelurahan | Negeri | Swasta | Akreditasi A | Akreditasi B | Akreditasi C |
|---|---|---|---|---|---|
| Rimba Jaya | 5 | 21 | 1 | 11 | 6 |
| Maro | 4 | 17 | 5 | 4 | 1 |
| Kelapa Lima | 6 | 14 | 5 | 4 | 2 |
| Samkai | 2 | 16 | 1 | 4 | 7 |
| Mandala | 3 | 13 | 5 | 7 | 1 |
| Karang Indah | 2 | 9 | 3 | 2 | 2 |
| Bambu Pemali | 2 | 6 | 1 | 2 | 1 |
| Kamundu | 1 | 5 | 0 | 3 | 1 |
| Muli | 1 | 5 | 1 | 1 | 1 |
| SERINGGU JAYA | 0 | 6 | 0 | 3 | 1 |
| Kamehedoga | 1 | 4 | 1 | 1 | 2 |
| Wasur | 3 | 1 | 0 | 0 | 1 |
| Nasem | 2 | 0 | 1 | 0 | 1 |
| Nggolar | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| Bokem | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 |
| Jati-jati | 0 | 1 | 0 | 0 | 1 |
| KELAPA V | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
Sejumlah desa/kelurahan di Kec. Merauke menjadi pusat pendidikan dengan jumlah sekolah yang lebih banyak dibanding wilayah lainnya.. Misalnya:
JL. Kamizaun - Mopah Lama
JL. BIAK MERAUKE
JL. NOWARI No 97
Jl. Brawijaya, Merauke - Papua
JL.KAMIZAUN MERAUKE
Jl. Pendidikan Merauke