Kec. Fak-Fak terus menunjukkan perkembangan yang positif di bidang pendidikan. Dengan jumlah sekolah yang tersebar merata di berbagai desa dan kelurahan, wilayah ini berupaya memberikan akses pendidikan yang lebih baik untuk seluruh warganya. Berbagai pilihan jenjang pendidikan tersedia, mulai dari tingkat dasar hingga menengah, guna memenuhi kebutuhan masyarakat di Kec. Fak-Fak.
Jl. Fakfak Sanggram
Jl. Fakfak-Weri
Jln. Kampung Wayati Timur
Jln. Fakfak - Sanggram
Jln. Kampung Kwama
Jalan Fakfak - Sanggram
Yos Sudarso
Kapten Napitupulu
Jalan Christina Marta Tiahahu
| Nama Kelurahan | Negeri | Swasta | Akreditasi A | Akreditasi B | Akreditasi C |
|---|---|---|---|---|---|
| FAK FAK UTARA | 4 | 13 | 4 | 10 | 3 |
| FAK FAK SELATAN | 2 | 9 | 1 | 5 | 4 |
| DANA WERIA | 0 | 9 | 1 | 5 | 3 |
| KAYU MERAH | 3 | 6 | 2 | 2 | 4 |
| WAGOM UTARA | 1 | 8 | 0 | 6 | 3 |
| GEWERPE | 0 | 3 | 0 | 2 | 0 |
| KIAT | 2 | 1 | 1 | 0 | 2 |
| NEMEWIKARYA | 1 | 2 | 0 | 0 | 2 |
| PASIR PUTIH | 0 | 3 | 1 | 1 | 1 |
| PIRMA | 1 | 2 | 0 | 1 | 0 |
| PURWASAK | 3 | 0 | 0 | 2 | 1 |
| SEKRU | 1 | 2 | 0 | 1 | 2 |
| TANAMA | 0 | 3 | 0 | 1 | 1 |
| WAGOM SELATAN | 2 | 1 | 2 | 0 | 1 |
| BRONGKENDIK | 1 | 1 | 0 | 1 | 0 |
| KAMPUNG KWAMA | 1 | 1 | 0 | 0 | 1 |
| KAPAURTUTIN | 0 | 2 | 0 | 0 | 1 |
| KATEMBA | 1 | 1 | 1 | 1 | 0 |
| LUSI PERI | 0 | 2 | 0 | 1 | 0 |
| SAKARTEMIN | 0 | 2 | 0 | 0 | 1 |
| SANGGRAM | 1 | 1 | 0 | 1 | 1 |
| WERBA | 0 | 2 | 0 | 1 | 1 |
| WERI | 2 | 0 | 0 | 0 | 2 |
| DULAN POK POK | 0 | 1 | 0 | 0 | 1 |
| KAMPUNG KALAMANUK | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 |
| KAMPUNG SIBORU | 0 | 1 | 0 | 0 | 1 |
| KAMPUNG WAMBAR TIMUR | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 |
| KAMPUNG WAYATI | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| KANANTARE | 0 | 1 | 0 | 0 | 1 |
| KWUHKENDIK | 0 | 1 | 0 | 0 | 1 |
| MANDOPMA | 0 | 1 | 0 | 0 | 1 |
| RADURIA | 0 | 1 | 0 | 1 | 0 |
| SAHAREI | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 |
| SEKBAN | 0 | 1 | 0 | 0 | 1 |
| SIBORU | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| TOREA | 0 | 1 | 0 | 1 | 0 |
| TUNAS GAIN | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 |
| URAT | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 |
| WAYATI | 0 | 1 | 0 | 0 | 1 |
| WAYATI BARAT | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| WAYATI TIMUR | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| WERABUAN | 0 | 1 | 0 | 0 | 1 |
| WRIKAPAL | 0 | 1 | 0 | 0 | 1 |
| WURKENDIK | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 |
Sejumlah desa/kelurahan di Kec. Fak-Fak menjadi pusat pendidikan dengan jumlah sekolah yang lebih banyak dibanding wilayah lainnya.. Misalnya:
JL. LA TONDE FF
Jl.brawijaya Fakfak
Jalan Trikora II
JL. PELOPOR- PUNCAK ONIM
Jalan.mr.moh.yamin Fakfak
JL. M.T. HARYONO FAKFAK