Kec. Kota Kefamenanu terus menunjukkan perkembangan yang positif di bidang pendidikan. Dengan jumlah sekolah yang tersebar merata di berbagai desa dan kelurahan, wilayah ini berupaya memberikan akses pendidikan yang lebih baik untuk seluruh warganya. Berbagai pilihan jenjang pendidikan tersedia, mulai dari tingkat dasar hingga menengah, guna memenuhi kebutuhan masyarakat di Kec. Kota Kefamenanu.
Ahmad Yani Km 4 Jurusan Atambua
RT 09 RW 14
Jln Raya Kefa - Naen
JALAN DIPONEGORO RT 17 RW 06
NAEN RT 21 RW 06
Jln. KM. 5 Jurusan Atambua
Jalan Anugerah RT 17 RW 05
JALAN PENE KOKO
Jalan Mayjen El Tari RT 30
| Nama Kelurahan | Negeri | Swasta | Akreditasi A | Akreditasi B | Akreditasi C |
|---|---|---|---|---|---|
| KEFAMENANU SELATAN | 2 | 19 | 3 | 5 | 5 |
| TUBUHUE | 5 | 14 | 0 | 5 | 4 |
| MAUBELI | 6 | 12 | 1 | 3 | 5 |
| BENPASI | 2 | 11 | 3 | 5 | 2 |
| KEFAMENANU TENGAH | 2 | 10 | 0 | 5 | 3 |
| BANSONE | 6 | 5 | 0 | 5 | 2 |
| SASI | 2 | 8 | 3 | 3 | 0 |
| APLASI | 1 | 8 | 1 | 5 | 0 |
| KEFAMENANU UTARA | 0 | 6 | 0 | 1 | 0 |
Sejumlah desa/kelurahan di Kec. Kota Kefamenanu menjadi pusat pendidikan dengan jumlah sekolah yang lebih banyak dibanding wilayah lainnya.. Misalnya:
JL. EL TARI KM. 09
JL. SASI KEFAMENANU
JL. SONBAY
Jln. Basuki Rahmat Kefamenanu
Jln. El-tari Km 7
Jln. Patimura