Kec. Fatuleu terus menunjukkan perkembangan yang positif di bidang pendidikan. Dengan jumlah sekolah yang tersebar merata di berbagai desa dan kelurahan, wilayah ini berupaya memberikan akses pendidikan yang lebih baik untuk seluruh warganya. Berbagai pilihan jenjang pendidikan tersedia, mulai dari tingkat dasar hingga menengah, guna memenuhi kebutuhan masyarakat di Kec. Fatuleu.
Beshala
SILLU
Kiuoni
Jl. Jurusan Oelkiu
JL. JURUSAN TANAH MERAH
DUSUN IV BESTEO
Nefona
Oebola
Jalan Syalom
| Nama Kelurahan | Negeri | Swasta | Akreditasi A | Akreditasi B | Akreditasi C |
|---|---|---|---|---|---|
| CAMPLONG I | 3 | 12 | 0 | 4 | 3 |
| SILLU | 9 | 6 | 0 | 4 | 3 |
| KUIMASI | 7 | 5 | 0 | 8 | 0 |
| CAMPLONG II | 4 | 7 | 0 | 2 | 2 |
| EKATETA | 7 | 4 | 0 | 1 | 4 |
| NUNSAEN | 5 | 6 | 0 | 2 | 4 |
| NAUNU | 3 | 6 | 0 | 1 | 0 |
| OELBITENO | 5 | 4 | 0 | 0 | 6 |
| TUAKAU | 4 | 5 | 0 | 1 | 1 |
| KIUONI | 5 | 3 | 0 | 0 | 6 |
| OEBOLA | 5 | 2 | 0 | 2 | 2 |
| POTO | 4 | 3 | 1 | 0 | 4 |
| TOLNAKU | 3 | 4 | 1 | 0 | 1 |
| NONBAUN | 5 | 1 | 1 | 1 | 2 |
| KALALI | 2 | 2 | 0 | 1 | 0 |
| NAITAE | 3 | 1 | 0 | 1 | 2 |
| NUATAUS | 2 | 2 | 0 | 1 | 0 |
| PASSI | 2 | 1 | 0 | 1 | 1 |
| OEBOLA DALAM | 2 | 0 | 0 | 1 | 1 |
| KABUKA/NUNSAEN | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
Sejumlah desa/kelurahan di Kec. Fatuleu menjadi pusat pendidikan dengan jumlah sekolah yang lebih banyak dibanding wilayah lainnya.. Misalnya:
Nekon
Nonbaun
Bonatama
JL. TIMOR RAYA KM. 39
DESA KUIMASI
Jl Timor Raya Km.39 Oelmasi