Kec. Ende terus menunjukkan perkembangan yang positif di bidang pendidikan. Dengan jumlah sekolah yang tersebar merata di berbagai desa dan kelurahan, wilayah ini berupaya memberikan akses pendidikan yang lebih baik untuk seluruh warganya. Berbagai pilihan jenjang pendidikan tersedia, mulai dari tingkat dasar hingga menengah, guna memenuhi kebutuhan masyarakat di Kec. Ende.
AEKORO
Buu Bei
KEKAJODHO
Kekawii
Kombandaru
Magengura
Ndetundora II
Panamata
Puubheto
| Nama Kelurahan | Negeri | Swasta | Akreditasi A | Akreditasi B | Akreditasi C |
|---|---|---|---|---|---|
| KEL. MAUTAPAGA | 9 | 17 | 3 | 11 | 3 |
| KEL. ONEKORE | 8 | 17 | 8 | 11 | 1 |
| KEL. KOTARATU | 4 | 12 | 4 | 7 | 3 |
| KEL. KOTARAJA | 2 | 10 | 2 | 6 | 0 |
| KEL. RUKUNLIMA | 3 | 9 | 2 | 5 | 2 |
| KEL. PAUPIRE | 0 | 11 | 1 | 6 | 1 |
| KEL. PAUPANDA | 4 | 5 | 1 | 4 | 3 |
| KEL. REWARANGGA | 3 | 6 | 1 | 5 | 2 |
| KEL. POTULANDO | 3 | 5 | 1 | 3 | 1 |
| KEL. TETANDARA | 3 | 5 | 1 | 2 | 3 |
| KEL. KELIMUTU | 3 | 4 | 2 | 3 | 0 |
| BOROKANDA | 2 | 3 | 1 | 4 | 0 |
| KEL. ROWORENA | 2 | 3 | 0 | 4 | 0 |
| KEL. ROWORENA BARAT | 1 | 4 | 1 | 2 | 0 |
| KEL. TANJUNG | 2 | 3 | 2 | 2 | 0 |
| NDETUNDORA II | 1 | 3 | 0 | 1 | 1 |
| RENGA MENGE | 0 | 4 | 0 | 1 | 1 |
| RIARAJA | 1 | 3 | 0 | 3 | 0 |
| RUKURAMBA | 0 | 4 | 0 | 2 | 0 |
| AEJETI | 1 | 2 | 0 | 0 | 1 |
| EMBU NGENA | 0 | 3 | 0 | 1 | 0 |
| KEL. REWARANGGA SELATAN | 1 | 2 | 0 | 2 | 1 |
| MBOTUTENDA | 2 | 1 | 0 | 1 | 1 |
| PUUTARA | 1 | 2 | 0 | 2 | 0 |
| RABURIA | 2 | 1 | 0 | 0 | 2 |
| RANDOTONDA | 1 | 2 | 0 | 1 | 1 |
| REDODORI | 2 | 1 | 0 | 0 | 2 |
| RORURANGGA | 2 | 1 | 0 | 1 | 1 |
| TINABANI | 1 | 2 | 0 | 1 | 2 |
| TOMBERABU I | 0 | 3 | 0 | 0 | 0 |
| TOMBERABU II | 1 | 2 | 0 | 0 | 1 |
| WOLOGAI | 2 | 1 | 0 | 0 | 1 |
| GHEOGHOMA | 0 | 2 | 0 | 2 | 0 |
| JAMOKEASA | 2 | 0 | 0 | 0 | 1 |
| KAZO KAPO | 1 | 1 | 0 | 0 | 1 |
| KEDEBODU | 1 | 1 | 0 | 0 | 1 |
| KEL. MBONGAWANI | 1 | 1 | 0 | 1 | 0 |
| NAKURAMBA | 0 | 2 | 0 | 0 | 1 |
| NDETUNDORA I | 1 | 1 | 0 | 1 | 0 |
| NDETUNDORA III | 1 | 1 | 0 | 1 | 1 |
| NDORIWOY | 1 | 1 | 0 | 0 | 1 |
| NDUNGGA | 0 | 2 | 0 | 1 | 1 |
| PADERAPE | 1 | 1 | 0 | 1 | 0 |
| RANDORAMA | 0 | 2 | 0 | 0 | 0 |
| RANORAMBA | 1 | 1 | 0 | 0 | 1 |
| RENDORATERUA | 1 | 1 | 0 | 2 | 0 |
| TIWUTEWA | 1 | 1 | 0 | 2 | 0 |
| TONGGOPAPA | 0 | 2 | 0 | 1 | 0 |
| UZURAMBA | 0 | 2 | 0 | 0 | 1 |
| WOLOGAI DUA | 0 | 2 | 0 | 0 | 0 |
| WORHOPAPA | 1 | 1 | 0 | 1 | 0 |
| Emburia | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| KELIMUTU | 0 | 1 | 0 | 1 | 0 |
| MBOMBA | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 |
| NEMBORAMBA | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| NUAJA | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 |
| PAUPIRE | 0 | 1 | 1 | 0 | 0 |
| RATERUA | 0 | 1 | 0 | 1 | 0 |
| TENDAMBONGGI | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| UZURAMBA BARAT | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| WAJAKEA JAYA | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| WATUSIPI | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| WAWONATO | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 |
| WOLOKARO | 0 | 1 | 0 | 0 | 1 |
Sejumlah desa/kelurahan di Kec. Ende menjadi pusat pendidikan dengan jumlah sekolah yang lebih banyak dibanding wilayah lainnya.. Misalnya:
JL. WIRAJAYA
JL. WOLOARE B
JL. Imam Bonjol No.39
JL. WIRAJAYA
Jln. Kelimutu
Jalan Wirajaya Ende