Kec. Ende terus menunjukkan perkembangan yang positif di bidang pendidikan. Dengan jumlah sekolah yang tersebar merata di berbagai desa dan kelurahan, wilayah ini berupaya memberikan akses pendidikan yang lebih baik untuk seluruh warganya. Berbagai pilihan jenjang pendidikan tersedia, mulai dari tingkat dasar hingga menengah, guna memenuhi kebutuhan masyarakat di Kec. Ende.
RT/RW.04/02 Dusun Rekko
Dusun Mau Au Atas
Jl.Puutara
Jl.Aejeti
Dusun Paribajo
Dusun Kemo
EKOREKO
METINUMBA
KERIMANDO
| Nama Kelurahan | Negeri | Swasta | Akreditasi A | Akreditasi B | Akreditasi C |
|---|---|---|---|---|---|
| KEL. MAUTAPAGA | 9 | 17 | 3 | 11 | 3 |
| KEL. ONEKORE | 8 | 17 | 8 | 11 | 1 |
| KEL. KOTARATU | 4 | 12 | 4 | 7 | 3 |
| KEL. KOTARAJA | 2 | 10 | 2 | 6 | 0 |
| KEL. RUKUNLIMA | 3 | 9 | 2 | 5 | 2 |
| KEL. PAUPIRE | 0 | 11 | 1 | 6 | 1 |
| KEL. PAUPANDA | 4 | 5 | 1 | 4 | 3 |
| KEL. REWARANGGA | 3 | 6 | 1 | 5 | 2 |
| KEL. POTULANDO | 3 | 5 | 1 | 3 | 1 |
| KEL. TETANDARA | 3 | 5 | 1 | 2 | 3 |
| KEL. KELIMUTU | 3 | 4 | 2 | 3 | 0 |
| BOROKANDA | 2 | 3 | 1 | 4 | 0 |
| KEL. ROWORENA | 2 | 3 | 0 | 4 | 0 |
| KEL. ROWORENA BARAT | 1 | 4 | 1 | 2 | 0 |
| KEL. TANJUNG | 2 | 3 | 2 | 2 | 0 |
| NDETUNDORA II | 1 | 3 | 0 | 1 | 1 |
| RENGA MENGE | 0 | 4 | 0 | 1 | 1 |
| RIARAJA | 1 | 3 | 0 | 3 | 0 |
| RUKURAMBA | 0 | 4 | 0 | 2 | 0 |
| AEJETI | 1 | 2 | 0 | 0 | 1 |
| EMBU NGENA | 0 | 3 | 0 | 1 | 0 |
| KEL. REWARANGGA SELATAN | 1 | 2 | 0 | 2 | 1 |
| MBOTUTENDA | 2 | 1 | 0 | 1 | 1 |
| PUUTARA | 1 | 2 | 0 | 2 | 0 |
| RABURIA | 2 | 1 | 0 | 0 | 2 |
| RANDOTONDA | 1 | 2 | 0 | 1 | 1 |
| REDODORI | 2 | 1 | 0 | 0 | 2 |
| RORURANGGA | 2 | 1 | 0 | 1 | 1 |
| TINABANI | 1 | 2 | 0 | 1 | 2 |
| TOMBERABU I | 0 | 3 | 0 | 0 | 0 |
| TOMBERABU II | 1 | 2 | 0 | 0 | 1 |
| WOLOGAI | 2 | 1 | 0 | 0 | 1 |
| GHEOGHOMA | 0 | 2 | 0 | 2 | 0 |
| JAMOKEASA | 2 | 0 | 0 | 0 | 1 |
| KAZO KAPO | 1 | 1 | 0 | 0 | 1 |
| KEDEBODU | 1 | 1 | 0 | 0 | 1 |
| KEL. MBONGAWANI | 1 | 1 | 0 | 1 | 0 |
| NAKURAMBA | 0 | 2 | 0 | 0 | 1 |
| NDETUNDORA I | 1 | 1 | 0 | 1 | 0 |
| NDETUNDORA III | 1 | 1 | 0 | 1 | 1 |
| NDORIWOY | 1 | 1 | 0 | 0 | 1 |
| NDUNGGA | 0 | 2 | 0 | 1 | 1 |
| PADERAPE | 1 | 1 | 0 | 1 | 0 |
| RANDORAMA | 0 | 2 | 0 | 0 | 0 |
| RANORAMBA | 1 | 1 | 0 | 0 | 1 |
| RENDORATERUA | 1 | 1 | 0 | 2 | 0 |
| TIWUTEWA | 1 | 1 | 0 | 2 | 0 |
| TONGGOPAPA | 0 | 2 | 0 | 1 | 0 |
| UZURAMBA | 0 | 2 | 0 | 0 | 1 |
| WOLOGAI DUA | 0 | 2 | 0 | 0 | 0 |
| WORHOPAPA | 1 | 1 | 0 | 1 | 0 |
| Emburia | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| KELIMUTU | 0 | 1 | 0 | 1 | 0 |
| MBOMBA | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 |
| NEMBORAMBA | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| NUAJA | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 |
| PAUPIRE | 0 | 1 | 1 | 0 | 0 |
| RATERUA | 0 | 1 | 0 | 1 | 0 |
| TENDAMBONGGI | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| UZURAMBA BARAT | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| WAJAKEA JAYA | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| WATUSIPI | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| WAWONATO | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 |
| WOLOKARO | 0 | 1 | 0 | 0 | 1 |
Sejumlah desa/kelurahan di Kec. Ende menjadi pusat pendidikan dengan jumlah sekolah yang lebih banyak dibanding wilayah lainnya.. Misalnya:
JL. WIRAJAYA
JL. WOLOARE B
JL. Imam Bonjol No.39
JL. WIRAJAYA
Jln. Kelimutu
Jalan Wirajaya Ende