Kec. Pulau-Pulau Babar terus menunjukkan perkembangan yang positif di bidang pendidikan. Dengan jumlah sekolah yang tersebar merata di berbagai desa dan kelurahan, wilayah ini berupaya memberikan akses pendidikan yang lebih baik untuk seluruh warganya. Berbagai pilihan jenjang pendidikan tersedia, mulai dari tingkat dasar hingga menengah, guna memenuhi kebutuhan masyarakat di Kec. Pulau-Pulau Babar.
Watrupun
SINAIRUSI-DAI
WATRUPUN
Yaltubung
Manuwui
Letziara
Jln. Tepa
Jln. Tepa
Jln. Watrupun
| Nama Kelurahan | Negeri | Swasta | Akreditasi A | Akreditasi B | Akreditasi C |
|---|---|---|---|---|---|
| TEPA | 5 | 4 | 2 | 6 | 0 |
| LETSIARA | 1 | 5 | 0 | 1 | 0 |
| TELA | 2 | 4 | 0 | 2 | 2 |
| MANUWUI | 1 | 2 | 0 | 0 | 1 |
| POTA BESAR | 2 | 1 | 0 | 1 | 2 |
| SINAIRUSI | 2 | 1 | 0 | 0 | 2 |
| HERTUTI | 0 | 2 | 0 | 0 | 1 |
| IMROING | 0 | 2 | 0 | 1 | 1 |
| LEWAH | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 |
| WASARILI | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 |
Sejumlah desa/kelurahan di Kec. Pulau-Pulau Babar menjadi pusat pendidikan dengan jumlah sekolah yang lebih banyak dibanding wilayah lainnya.. Misalnya:
JL. KARANG PANJANG
Tepa
JL. KARANG PANJANG TEPA
Masbuar
WATRUPUN