Kec. Babar Timur terus menunjukkan perkembangan yang positif di bidang pendidikan. Dengan jumlah sekolah yang tersebar merata di berbagai desa dan kelurahan, wilayah ini berupaya memberikan akses pendidikan yang lebih baik untuk seluruh warganya. Berbagai pilihan jenjang pendidikan tersedia, mulai dari tingkat dasar hingga menengah, guna memenuhi kebutuhan masyarakat di Kec. Babar Timur.
Jln. Nakarhamto
Kokwari
| Nama Kelurahan | Negeri | Swasta | Akreditasi A | Akreditasi B | Akreditasi C |
|---|---|---|---|---|---|
| LETWURUNG | 3 | 3 | 0 | 4 | 2 |
| AHANARI | 2 | 2 | 0 | 2 | 1 |
| KROING | 2 | 2 | 0 | 1 | 1 |
| NAKARHAMTO | 3 | 1 | 0 | 2 | 1 |
| YATOKE | 0 | 4 | 0 | 1 | 1 |
| ANALUTUR | 0 | 3 | 0 | 1 | 0 |
| KOKWARI | 1 | 2 | 0 | 0 | 1 |
| TUTUWAWANG | 2 | 1 | 0 | 2 | 0 |
| EMPALWAS | 1 | 1 | 0 | 0 | 1 |
| MANUARI | 1 | 1 | 0 | 0 | 1 |
| WAKPAPAPI | 0 | 2 | 0 | 1 | 0 |
| YALTUBUNG | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
Sejumlah desa/kelurahan di Kec. Babar Timur menjadi pusat pendidikan dengan jumlah sekolah yang lebih banyak dibanding wilayah lainnya.. Misalnya:
Ahanari
Nakarhamto
Tutuwawang
Desa Letwurung
Letwurung
Kroing