Kec. Pulau-Pulau Aru terus menunjukkan perkembangan yang positif di bidang pendidikan. Dengan jumlah sekolah yang tersebar merata di berbagai desa dan kelurahan, wilayah ini berupaya memberikan akses pendidikan yang lebih baik untuk seluruh warganya. Berbagai pilihan jenjang pendidikan tersedia, mulai dari tingkat dasar hingga menengah, guna memenuhi kebutuhan masyarakat di Kec. Pulau-Pulau Aru.
| Nama Kelurahan | Negeri | Swasta | Akreditasi A | Akreditasi B | Akreditasi C |
|---|---|---|---|---|---|
| SIWALIMA | 15 | 38 | 2 | 22 | 12 |
| GALAYDUBU | 2 | 9 | 4 | 3 | 3 |
| WANGEL | 3 | 3 | 0 | 3 | 3 |
| WOKAM | 2 | 3 | 0 | 1 | 2 |
| DURJELA | 1 | 3 | 1 | 0 | 2 |
| JABULENGA | 0 | 3 | 0 | 1 | 1 |
| KARANGGULI | 1 | 2 | 0 | 0 | 2 |
| SAMANG | 2 | 1 | 0 | 2 | 1 |
| GORAR | 1 | 1 | 0 | 0 | 1 |
| LAU-LAU | 0 | 2 | 0 | 0 | 1 |
| NAPAR | 2 | 0 | 0 | 2 | 0 |
| TUNGU | 0 | 2 | 0 | 0 | 1 |
| UJIR | 1 | 1 | 0 | 0 | 1 |
| KOBRAUR | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 |
| TUNGUWATU | 0 | 1 | 0 | 0 | 1 |
Sejumlah desa/kelurahan di Kec. Pulau-Pulau Aru menjadi pusat pendidikan dengan jumlah sekolah yang lebih banyak dibanding wilayah lainnya.. Misalnya:
Jalan Ali Moertopo
Jln. Mutiara
JL. JALABIL
JL. MUTIARA NO. 132
Jln. Ali Moertopo
Jln. Kapitan Mailongi
