Kec. Magersari terus menunjukkan perkembangan yang positif di bidang pendidikan. Dengan jumlah sekolah yang tersebar merata di berbagai desa dan kelurahan, wilayah ini berupaya memberikan akses pendidikan yang lebih baik untuk seluruh warganya. Berbagai pilihan jenjang pendidikan tersedia, mulai dari tingkat dasar hingga menengah, guna memenuhi kebutuhan masyarakat di Kec. Magersari.
JL KAMBOJA NO 4 WATES
WATES GG II/11
GUNUNG ANYAR RT 2 RW 6
EMPUNALA 215
JL. KARANGLO VI/46
EMPUNALA 306 B
RAYA IJEN NO 11
KEDUNG SARI
BALAI DESA GANG BUNTU
| Nama Kelurahan | Negeri | Swasta | Akreditasi A | Akreditasi B | Akreditasi C |
|---|---|---|---|---|---|
| WATES | 9 | 26 | 15 | 12 | 0 |
| KEDUNDUNG | 3 | 22 | 4 | 12 | 2 |
| Balongsari | 7 | 11 | 9 | 7 | 0 |
| MAGERSARI | 3 | 9 | 4 | 3 | 3 |
| GUNUNG GEDANGAN | 2 | 8 | 2 | 5 | 0 |
| GEDONGAN | 4 | 4 | 6 | 1 | 0 |
| PURWOTENGAH | 0 | 2 | 2 | 0 | 0 |
| JAGALAN | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| KRANGGAN | 0 | 1 | 0 | 1 | 0 |
| SENTANAN | 0 | 1 | 1 | 0 | 0 |
Sejumlah desa/kelurahan di Kec. Magersari menjadi pusat pendidikan dengan jumlah sekolah yang lebih banyak dibanding wilayah lainnya.. Misalnya:
JL. RAYA KEDUNGSARI
JL. PANDERMAN VIII
JL. RAYA IJEN NO. 09
Jl. Gajah Mada No. 143
JL. PEMUDA NO. 33
Jl. Semeru Wates Mojokerto