Kec. Pesantren terus menunjukkan perkembangan yang positif di bidang pendidikan. Dengan jumlah sekolah yang tersebar merata di berbagai desa dan kelurahan, wilayah ini berupaya memberikan akses pendidikan yang lebih baik untuk seluruh warganya. Berbagai pilihan jenjang pendidikan tersedia, mulai dari tingkat dasar hingga menengah, guna memenuhi kebutuhan masyarakat di Kec. Pesantren.
Jl.KAMBOJA RT 14 RW 05
WARINGIN NO. 132
TIRTOUDAN RAYA NO. 153
CAKARSI RAYA
JL. LETJEN SUTOYO III BURENGAN
JOYOBOYO GG. I NO. 4
PERUM CAHAYA PERMATA BLOK VII / 6 LINGK BENCE- PAKUNDEN
BANARAN 108
HOS COKROAMINOTO 195
| Nama Kelurahan | Negeri | Swasta | Akreditasi A | Akreditasi B | Akreditasi C |
|---|---|---|---|---|---|
| BURENGAN | 5 | 9 | 5 | 4 | 0 |
| TOSAREN | 3 | 11 | 3 | 7 | 0 |
| PESANTREN | 2 | 11 | 4 | 5 | 1 |
| BANARAN | 2 | 10 | 4 | 4 | 0 |
| BLABAK | 4 | 8 | 1 | 6 | 1 |
| BAWANG | 4 | 7 | 3 | 7 | 0 |
| SINGONEGARAN | 3 | 8 | 2 | 4 | 1 |
| JAMSAREN | 2 | 8 | 2 | 5 | 0 |
| PAKUNDEN | 2 | 8 | 3 | 4 | 0 |
| TINALAN | 2 | 7 | 2 | 2 | 1 |
| BANGSAL | 4 | 3 | 4 | 1 | 0 |
| KETAMI | 2 | 5 | 2 | 3 | 0 |
| TEMPUREJO | 2 | 5 | 2 | 1 | 1 |
| BETET | 2 | 2 | 1 | 2 | 0 |
| NGLETIH | 1 | 3 | 1 | 1 | 0 |
Sejumlah desa/kelurahan di Kec. Pesantren menjadi pusat pendidikan dengan jumlah sekolah yang lebih banyak dibanding wilayah lainnya.. Misalnya:
JL. MAUNI 88
Jl. Raya Kleco
Jl. Letjen Suprapto No.44
Jl. Raya Ngletih
Jl. Raya Betet
Jl Brig. Pol. Imam Bachri 123