Kec. Kota Sumenep terus menunjukkan perkembangan yang positif di bidang pendidikan. Dengan jumlah sekolah yang tersebar merata di berbagai desa dan kelurahan, wilayah ini berupaya memberikan akses pendidikan yang lebih baik untuk seluruh warganya. Berbagai pilihan jenjang pendidikan tersedia, mulai dari tingkat dasar hingga menengah, guna memenuhi kebutuhan masyarakat di Kec. Kota Sumenep.
Jl. Yos Sudarso 215
Jl.Jaksa Agung Suprapto No.14 Sumenep
Jl.Dr.Cipto Nomor : 5A Kolor Sumenep
Jl. KH. Zainal Arifin no 1-9 terate
JLN KH MANSYUR NO 7B PABIAN SUMENEP
Jl.Dr Soetomo No 83 Pajagalan Sumenep
JL. KH. AGUS SALIM NO.286 KANTOR KEMENTERIAN AGAMA KABUPATEN SUMENEP
RAYA MANDING KEBUNAN SUMENEP
Jl.Dr Soetomo No 83 Kelurahan Pajagalan Sumenep
| Nama Kelurahan | Negeri | Swasta | Akreditasi A | Akreditasi B | Akreditasi C |
|---|---|---|---|---|---|
| PABIAN | 7 | 22 | 9 | 9 | 2 |
| PANGARANGAN | 6 | 19 | 10 | 8 | 1 |
| PAMOLOKAN | 4 | 14 | 2 | 5 | 3 |
| KOLOR | 4 | 13 | 4 | 5 | 1 |
| PANDIAN | 4 | 12 | 5 | 7 | 1 |
| Pajagalan | 2 | 13 | 3 | 6 | 1 |
| KARANGDUAK | 2 | 10 | 1 | 2 | 1 |
| BANGSELOK | 1 | 9 | 1 | 3 | 1 |
| KEBUNAN | 2 | 8 | 0 | 5 | 2 |
| KEBUNAGUNG | 1 | 6 | 0 | 2 | 2 |
| MARENGAN DAYA | 3 | 3 | 2 | 2 | 1 |
| KEPANJIN | 1 | 4 | 1 | 1 | 1 |
| PABERASAN | 2 | 3 | 2 | 1 | 0 |
| PARSANGA | 3 | 1 | 2 | 2 | 0 |
| BANGKAL | 1 | 1 | 1 | 1 | 0 |
| Kacongan | 1 | 1 | 1 | 1 | 0 |
Sejumlah desa/kelurahan di Kec. Kota Sumenep menjadi pusat pendidikan dengan jumlah sekolah yang lebih banyak dibanding wilayah lainnya.. Misalnya:
JL. KH. WAHID HASYIM III / 11
JL. PAYUDAN TIMUR 1
Jl. Payudan Barat No. 9
Jl.Payudan Barat No 7
Jl. Yos Sudarso 215
Jl. Kartini Gg VI/04