Kec. Wonoayu terus menunjukkan perkembangan yang positif di bidang pendidikan. Dengan jumlah sekolah yang tersebar merata di berbagai desa dan kelurahan, wilayah ini berupaya memberikan akses pendidikan yang lebih baik untuk seluruh warganya. Berbagai pilihan jenjang pendidikan tersedia, mulai dari tingkat dasar hingga menengah, guna memenuhi kebutuhan masyarakat di Kec. Wonoayu.
Desa Ploso RT 15 RW 03
DS. JIMBARAN KULON RT4 RW 1
JL KARYA INDAN RT 2 RW 2 DESA POPOH
Raya Pilang RT 02 RW 01
Balai desa Semambung
DUSUN KERSAN RT 16 RW 6
Gundowijoyo RT 06 RW 04
Jl. Raya Ketimang
TANGGUL WETAN RT 01 RW 02
| Nama Kelurahan | Negeri | Swasta | Akreditasi A | Akreditasi B | Akreditasi C |
|---|---|---|---|---|---|
| PILANG | 2 | 11 | 1 | 6 | 1 |
| WONOAYU | 2 | 10 | 3 | 6 | 0 |
| WONOKASIAN | 2 | 8 | 4 | 1 | 2 |
| POPOH | 1 | 8 | 2 | 4 | 0 |
| SAWOCANGKRING | 1 | 8 | 2 | 1 | 2 |
| CANDINEGORO | 1 | 6 | 1 | 2 | 0 |
| JIMBARAN KULON | 1 | 6 | 1 | 3 | 1 |
| KARANGPURI | 2 | 5 | 3 | 1 | 1 |
| KETIMANG | 1 | 6 | 2 | 2 | 2 |
| PAGERNGUMBUK | 3 | 4 | 3 | 1 | 1 |
| PLAOSAN | 2 | 5 | 1 | 2 | 1 |
| SEMAMBUNG | 2 | 5 | 3 | 1 | 0 |
| SUMBEREJO | 2 | 5 | 2 | 2 | 1 |
| BECIRONGENGOR | 2 | 4 | 2 | 2 | 0 |
| PLOSO | 1 | 5 | 1 | 2 | 2 |
| TANGGUL | 1 | 5 | 1 | 3 | 0 |
| LAMBANGAN | 1 | 4 | 1 | 3 | 0 |
| MULYODADI | 1 | 4 | 1 | 2 | 0 |
| SIMO ANGIN ANGIN | 1 | 3 | 1 | 1 | 0 |
| WONOKALANG | 1 | 3 | 2 | 1 | 0 |
| JIMBARAN WETAN | 1 | 1 | 1 | 1 | 0 |
| MOJORANGAGUNG | 1 | 1 | 1 | 0 | 1 |
| SIMOKETAWANG | 1 | 1 | 1 | 1 | 0 |
Sejumlah desa/kelurahan di Kec. Wonoayu menjadi pusat pendidikan dengan jumlah sekolah yang lebih banyak dibanding wilayah lainnya.. Misalnya:
JL. RAYA PAGERNGUMBUK
Jl. Raya Semambung
Jl Becirongengor
Jl. Raya Jimbaran Kulon Rt.002 Rw. 001
Becirongengor
Jimbaran Wetan