Kec. Kebonagung terus menunjukkan perkembangan yang positif di bidang pendidikan. Dengan jumlah sekolah yang tersebar merata di berbagai desa dan kelurahan, wilayah ini berupaya memberikan akses pendidikan yang lebih baik untuk seluruh warganya. Berbagai pilihan jenjang pendidikan tersedia, mulai dari tingkat dasar hingga menengah, guna memenuhi kebutuhan masyarakat di Kec. Kebonagung.
Dsn. Jati
Dsn. Krajan Ds.Sanggrahan
Jalan Gayam - Worawari
Dsn. Krajan
Ds. Gawang
Rt.01 Rw.01
Rt. 04 Rw. 09 Dsn. Banar
Karangnongko
Dsn. Krajan
| Nama Kelurahan | Negeri | Swasta | Akreditasi A | Akreditasi B | Akreditasi C |
|---|---|---|---|---|---|
| GEMBUK | 2 | 15 | 0 | 10 | 0 |
| SIDOMULYO | 3 | 14 | 0 | 11 | 1 |
| KETRO | 4 | 10 | 2 | 7 | 0 |
| SANGGRAHAN | 2 | 10 | 0 | 7 | 0 |
| MANTREN | 1 | 10 | 0 | 5 | 2 |
| GAWANG | 2 | 8 | 0 | 7 | 0 |
| KLESEM | 2 | 8 | 0 | 4 | 1 |
| KARANGANYAR | 2 | 7 | 0 | 5 | 1 |
| PURWOASRI | 4 | 5 | 4 | 3 | 0 |
| PUNJUNG | 2 | 6 | 0 | 5 | 1 |
| KATIPUGAL | 2 | 5 | 0 | 4 | 0 |
| KETEPUNG | 2 | 5 | 0 | 5 | 1 |
| WORAWARI | 3 | 4 | 0 | 5 | 1 |
| PLUMBUNGAN | 1 | 5 | 0 | 3 | 1 |
| WONOGONDO | 2 | 4 | 0 | 5 | 0 |
| KARANGNONGKO | 2 | 3 | 1 | 2 | 1 |
| BANJARJO | 1 | 3 | 0 | 3 | 0 |
| KALIPELUS | 1 | 3 | 0 | 3 | 0 |
| KEBONAGUNG | 1 | 3 | 1 | 1 | 0 |
Sejumlah desa/kelurahan di Kec. Kebonagung menjadi pusat pendidikan dengan jumlah sekolah yang lebih banyak dibanding wilayah lainnya.. Misalnya:
Jl. Raya Kebonagung Pacitan
Jl. Pacitan-lorok
Dsn. Jati
Karangnongko
Jl. Raya Kebonagung
RT 01 RW 03 DUSUN JATI