Kec. Kebonagung terus menunjukkan perkembangan yang positif di bidang pendidikan. Dengan jumlah sekolah yang tersebar merata di berbagai desa dan kelurahan, wilayah ini berupaya memberikan akses pendidikan yang lebih baik untuk seluruh warganya. Berbagai pilihan jenjang pendidikan tersedia, mulai dari tingkat dasar hingga menengah, guna memenuhi kebutuhan masyarakat di Kec. Kebonagung.
RT 03 RW 06 DUSUN SRITEN, DESA GEMBUK, KEC KEBONAGUNG
DSN. PAKEL, DESA KARANGANYAR, KEC. KEBONAGUNG
RT 01 RW 01 DSN. GEBANG, DESA PLUMBUNGAN, KEC. KEBONAGUNG
RT 04 RW 13 DSN NONGKO, DESA KETRO, KEC. KEBONAGUNG
RT. 01 RW. 02 DSN TAWANG, DESA GEMBUK, KEC. KEBONAGUNG
RT.02 RW.12 GOMBONG, DESA KETEPUNG, KEC. KEBONAGUNG
RT 06 RW 09 DSN KLEPU, DESA KETRO, KEC. KEBONAGUNG
RT 01 RW 11 DSN NGAREN, DESA SANGGRAHAN, KEC. KEBONAGUNG
JL.SIDOMULYO-WAWARAN KM 02 DESA SIDOMULYO KEC. KEBONAGUNG
| Nama Kelurahan | Negeri | Swasta | Akreditasi A | Akreditasi B | Akreditasi C |
|---|---|---|---|---|---|
| GEMBUK | 2 | 15 | 0 | 10 | 0 |
| SIDOMULYO | 3 | 14 | 0 | 11 | 1 |
| KETRO | 4 | 10 | 2 | 7 | 0 |
| SANGGRAHAN | 2 | 10 | 0 | 7 | 0 |
| MANTREN | 1 | 10 | 0 | 5 | 2 |
| GAWANG | 2 | 8 | 0 | 7 | 0 |
| KLESEM | 2 | 8 | 0 | 4 | 1 |
| KARANGANYAR | 2 | 7 | 0 | 5 | 1 |
| PURWOASRI | 4 | 5 | 4 | 3 | 0 |
| PUNJUNG | 2 | 6 | 0 | 5 | 1 |
| KATIPUGAL | 2 | 5 | 0 | 4 | 0 |
| KETEPUNG | 2 | 5 | 0 | 5 | 1 |
| WORAWARI | 3 | 4 | 0 | 5 | 1 |
| PLUMBUNGAN | 1 | 5 | 0 | 3 | 1 |
| WONOGONDO | 2 | 4 | 0 | 5 | 0 |
| KARANGNONGKO | 2 | 3 | 1 | 2 | 1 |
| BANJARJO | 1 | 3 | 0 | 3 | 0 |
| KALIPELUS | 1 | 3 | 0 | 3 | 0 |
| KEBONAGUNG | 1 | 3 | 1 | 1 | 0 |
Sejumlah desa/kelurahan di Kec. Kebonagung menjadi pusat pendidikan dengan jumlah sekolah yang lebih banyak dibanding wilayah lainnya.. Misalnya:
Jl. Raya Kebonagung Pacitan
Jl. Pacitan-lorok
Karangnongko
Dsn. Jati
Jl. Raya Kebonagung
RT 01 RW 03 DUSUN JATI