Kec. Kota Bogor Selatan terus menunjukkan perkembangan yang positif di bidang pendidikan. Dengan jumlah sekolah yang tersebar merata di berbagai desa dan kelurahan, wilayah ini berupaya memberikan akses pendidikan yang lebih baik untuk seluruh warganya. Berbagai pilihan jenjang pendidikan tersedia, mulai dari tingkat dasar hingga menengah, guna memenuhi kebutuhan masyarakat di Kec. Kota Bogor Selatan.
JL. BATUTULIS NO. 66
JL. PAHLAWAN NO. 96 BOGOR
JL. SILIWANGI NO. 50 BOGOR
JL. BATUTULIS GG. BALEKAMBANG BOGOR
JL. PAHLAWAN NO. 140 BOGOR
JL. Rulita Km.08 Rt.003/005
JL. MAYJEN H.E. SUKMA, SIMPANGAN BAKOM
JL. KAPTEN YUSUF GG EMAD KP. DUKUH JAWA RTO4/06
JL. WARUNG LIMUS RT 04/09 MULYAHARJA
| Nama Kelurahan | Negeri | Swasta | Akreditasi A | Akreditasi B | Akreditasi C |
|---|---|---|---|---|---|
| EMPANG | 4 | 30 | 19 | 11 | 1 |
| MULYAHARJA | 5 | 20 | 7 | 7 | 3 |
| BONDONGAN | 1 | 17 | 8 | 5 | 3 |
| BATUTULIS | 3 | 14 | 8 | 5 | 1 |
| PAMOYANAN | 3 | 14 | 5 | 4 | 1 |
| BOJONGKERTA | 2 | 12 | 5 | 5 | 0 |
| CIKARET | 2 | 12 | 5 | 2 | 1 |
| CIPAKU | 5 | 9 | 4 | 4 | 3 |
| MUARASARI | 4 | 10 | 2 | 8 | 0 |
| HARJASARI | 2 | 10 | 7 | 1 | 1 |
| LAWANGGINTUNG | 3 | 8 | 2 | 5 | 0 |
| RANGGAMEKAR | 4 | 7 | 7 | 2 | 1 |
| RANCAMAYA | 3 | 6 | 3 | 2 | 1 |
| PAKUAN | 1 | 4 | 2 | 1 | 1 |
| GENTENG | 1 | 3 | 1 | 3 | 0 |
| KERTAMAYA | 1 | 3 | 1 | 0 | 0 |
| Batu Tulis | 0 | 2 | 0 | 0 | 0 |
| TAJUR | 0 | 1 | 0 | 0 | 1 |
Sejumlah desa/kelurahan di Kec. Kota Bogor Selatan menjadi pusat pendidikan dengan jumlah sekolah yang lebih banyak dibanding wilayah lainnya.. Misalnya:
KP. BUNTAR KELURAHAN MUARASARI
JL. DREDED V NO.36
Jalan Dereded V Nomor 14 Bogor
JL. KOMPLEK PERUMDA I CIPAKU BOGOR
Rancamaya
Jl. Pamoyanan No. 022