Kec. Popayato terus menunjukkan perkembangan yang positif di bidang pendidikan. Dengan jumlah sekolah yang tersebar merata di berbagai desa dan kelurahan, wilayah ini berupaya memberikan akses pendidikan yang lebih baik untuk seluruh warganya. Berbagai pilihan jenjang pendidikan tersedia, mulai dari tingkat dasar hingga menengah, guna memenuhi kebutuhan masyarakat di Kec. Popayato.
JL. TRANS SULAWESI
JL. GAJAH MADA
Jl. Desa Bukit Tingki
JL TRANS SULAWESI
Cendrawasih
Jalan Wisata
Merpati
DESA
Pelabuhan
| Nama Kelurahan | Negeri | Swasta | Akreditasi A | Akreditasi B | Akreditasi C |
|---|---|---|---|---|---|
| POPAYATO | 1 | 11 | 0 | 5 | 7 |
| MOLOSIPAT | 5 | 6 | 1 | 6 | 4 |
| BUKIT TINGKI | 4 | 5 | 0 | 4 | 4 |
| DUDEWULO | 3 | 5 | 0 | 1 | 5 |
| PADENGO | 1 | 4 | 1 | 2 | 2 |
| PERSATUAN | 2 | 3 | 0 | 2 | 3 |
| MOLOSIPAT UTARA | 0 | 4 | 0 | 3 | 0 |
| BUMI BAHARI | 2 | 1 | 0 | 1 | 2 |
| BUTUNGALE | 1 | 2 | 0 | 2 | 1 |
| DAMBALO | 1 | 2 | 0 | 1 | 2 |
| TELAGA BIRU | 1 | 2 | 1 | 1 | 1 |
| TOROSIAJE | 2 | 1 | 0 | 2 | 1 |
| TOROSIAJE JAYA | 2 | 1 | 0 | 2 | 1 |
| TUNAS JAYA | 1 | 2 | 1 | 1 | 1 |
| TELAGA | 1 | 1 | 0 | 1 | 1 |
| TRIKORA | 1 | 1 | 0 | 1 | 1 |
| TUNAS HARAPAN | 1 | 1 | 0 | 0 | 2 |
Sejumlah desa/kelurahan di Kec. Popayato menjadi pusat pendidikan dengan jumlah sekolah yang lebih banyak dibanding wilayah lainnya.. Misalnya:
Popayato
Molosipat
Jl.trans Sulawesi
Tunas Jaya
JL. TRANS SULAWESI
BUMI BAHARI