Kec. Mootilango terus menunjukkan perkembangan yang positif di bidang pendidikan. Dengan jumlah sekolah yang tersebar merata di berbagai desa dan kelurahan, wilayah ini berupaya memberikan akses pendidikan yang lebih baik untuk seluruh warganya. Berbagai pilihan jenjang pendidikan tersedia, mulai dari tingkat dasar hingga menengah, guna memenuhi kebutuhan masyarakat di Kec. Mootilango.
| Nama Kelurahan | Negeri | Swasta | Akreditasi A | Akreditasi B | Akreditasi C |
|---|---|---|---|---|---|
| PILOMONU | 6 | 8 | 0 | 7 | 5 |
| SIDO MUKTI | 3 | 7 | 0 | 8 | 0 |
| HUYULA | 2 | 5 | 2 | 2 | 2 |
| PARIS | 4 | 3 | 3 | 3 | 0 |
| SUKA MAJU | 3 | 4 | 0 | 5 | 0 |
| KARYA MUKTI | 0 | 6 | 1 | 2 | 1 |
| PAYU | 3 | 1 | 1 | 2 | 1 |
| SATRIA | 2 | 2 | 0 | 2 | 1 |
| TALUMOPATU | 1 | 3 | 0 | 3 | 0 |
| HELUMO | 1 | 2 | 1 | 1 | 1 |
Sejumlah desa/kelurahan di Kec. Mootilango menjadi pusat pendidikan dengan jumlah sekolah yang lebih banyak dibanding wilayah lainnya.. Misalnya:
Jl. Bendungan
Jalan Bendungan
Jln. Pelabuhan Anggrek
Jl. Hi. Salim Manumba
JL. BENDUNGAN
DESA HELUMO