Kec. Labuan terus menunjukkan perkembangan yang positif di bidang pendidikan. Dengan jumlah sekolah yang tersebar merata di berbagai desa dan kelurahan, wilayah ini berupaya memberikan akses pendidikan yang lebih baik untuk seluruh warganya. Berbagai pilihan jenjang pendidikan tersedia, mulai dari tingkat dasar hingga menengah, guna memenuhi kebutuhan masyarakat di Kec. Labuan.
Jl. Lamalagau, No. 03
JL. TOMBUA, NO. 1 LABUAN LELEA
JL. LANTIGAU NO. 13
JL. Pemuda, NO. 23
Jln.Mangga II Desa Labuan Lelea
Labuan Salumbone
Desa Labuan Kungguma
Desa Labuan Salumbone
Mapane, Labuan Kungguma
| Nama Kelurahan | Negeri | Swasta | Akreditasi A | Akreditasi B | Akreditasi C |
|---|---|---|---|---|---|
| LABUAN | 7 | 6 | 1 | 4 | 2 |
| LABUAN PANIMBA | 3 | 6 | 1 | 3 | 1 |
| LABUAN TOPOSO | 5 | 3 | 0 | 4 | 2 |
| LABUAN KUNGGUMA | 3 | 4 | 0 | 4 | 2 |
| LABUAN LELEA | 2 | 5 | 0 | 3 | 2 |
| LABUAN SALUMBONE | 2 | 3 | 0 | 5 | 0 |
Sejumlah desa/kelurahan di Kec. Labuan menjadi pusat pendidikan dengan jumlah sekolah yang lebih banyak dibanding wilayah lainnya.. Misalnya:
Jl. Kajaboya
JL. Pemuda, NO. 23
Jl. Kramat Raya No. 27
Labuan
Dusun Dalika
Jl. mawar