Kec. Depapre terus menunjukkan perkembangan yang positif di bidang pendidikan. Dengan jumlah sekolah yang tersebar merata di berbagai desa dan kelurahan, wilayah ini berupaya memberikan akses pendidikan yang lebih baik untuk seluruh warganya. Berbagai pilihan jenjang pendidikan tersedia, mulai dari tingkat dasar hingga menengah, guna memenuhi kebutuhan masyarakat di Kec. Depapre.
Jln. Waiya Depapre
JL. RAYA DEPAPRE DOROMENA SENTANI
Jl. Depapre- Dormena Kampung Tablasupa
Jl. Depapre
Jl. Depapre - Doromena
Jl. Teluk Waiya
Jl. Doromena-Depapre
Jalan Depapre - Dormena
Jl. Pendidikan
| Nama Kelurahan | Negeri | Swasta | Akreditasi A | Akreditasi B | Akreditasi C |
|---|---|---|---|---|---|
| TABLASUPA | 1 | 5 | 0 | 0 | 3 |
| WAIYA | 2 | 2 | 0 | 1 | 1 |
| YEWENA | 2 | 1 | 0 | 0 | 2 |
| ENTIYEBO | 0 | 2 | 0 | 1 | 0 |
| YEPASE | 0 | 2 | 0 | 1 | 0 |
| DOROMENA | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| KENDATE | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 |
| WAMBENA | 0 | 1 | 0 | 1 | 0 |
Sejumlah desa/kelurahan di Kec. Depapre menjadi pusat pendidikan dengan jumlah sekolah yang lebih banyak dibanding wilayah lainnya.. Misalnya:
Jl. Teluk Waiya
Jln. Kampung Yapase
Jl. Yonipi RT 01/RW 01
Jl. Pendidikan
Jl. Depapre - Doromena
JL. RAYA DEPAPRE DOROMENA SENTANI