Kec. Fautmolo terus menunjukkan perkembangan yang positif di bidang pendidikan. Dengan jumlah sekolah yang tersebar merata di berbagai desa dan kelurahan, wilayah ini berupaya memberikan akses pendidikan yang lebih baik untuk seluruh warganya. Berbagai pilihan jenjang pendidikan tersedia, mulai dari tingkat dasar hingga menengah, guna memenuhi kebutuhan masyarakat di Kec. Fautmolo.
Besleu
Nunukniti
Oenae
Tol
Bileon
Tunis
Letemneo
SEBANI
Oeleon
| Nama Kelurahan | Negeri | Swasta | Akreditasi A | Akreditasi B | Akreditasi C |
|---|---|---|---|---|---|
| OELEON | 5 | 1 | 0 | 0 | 3 |
| SILLU | 2 | 4 | 0 | 0 | 0 |
| BILEON | 3 | 1 | 0 | 2 | 0 |
| KAENENO | 1 | 3 | 0 | 1 | 0 |
| TUNIS | 1 | 3 | 0 | 0 | 2 |
| NUNUHAKNITI | 0 | 2 | 0 | 1 | 0 |
| BESLEU | 0 | 1 | 0 | 0 | 1 |
| DESA NUNUKNKITI | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
Sejumlah desa/kelurahan di Kec. Fautmolo menjadi pusat pendidikan dengan jumlah sekolah yang lebih banyak dibanding wilayah lainnya.. Misalnya:
Bileon
Letemneo
TAYNE FALLO
Kampung Taniun, Sillu
Jln. Tunam
UPUNKOI