Kec. Naga Wutung terus menunjukkan perkembangan yang positif di bidang pendidikan. Dengan jumlah sekolah yang tersebar merata di berbagai desa dan kelurahan, wilayah ini berupaya memberikan akses pendidikan yang lebih baik untuk seluruh warganya. Berbagai pilihan jenjang pendidikan tersedia, mulai dari tingkat dasar hingga menengah, guna memenuhi kebutuhan masyarakat di Kec. Naga Wutung.
Loang
Belame
Jln. Trans Nagawutung
Boto
Lamalewar
Lewoblolong
Pasir Putih
Tewaowutung
Baobolak
| Nama Kelurahan | Negeri | Swasta | Akreditasi A | Akreditasi B | Akreditasi C |
|---|---|---|---|---|---|
| PASIR PUTIH | 2 | 3 | 0 | 2 | 2 |
| BABOKERONG | 1 | 2 | 0 | 1 | 2 |
| BELABAJA | 1 | 2 | 0 | 1 | 0 |
| DUAWUTUN | 3 | 0 | 1 | 1 | 0 |
| IDALOLONG | 0 | 3 | 0 | 0 | 1 |
| TEWAOWUTUNG | 2 | 1 | 0 | 2 | 0 |
| BAOBOLAK | 0 | 2 | 0 | 1 | 0 |
| BOLIBEAN | 1 | 1 | 0 | 0 | 1 |
| ILE BOLI | 1 | 1 | 0 | 0 | 1 |
| LABALIMUT | 1 | 1 | 0 | 1 | 0 |
| LOLONG | 1 | 1 | 0 | 0 | 1 |
| PENIKENE | 1 | 1 | 0 | 1 | 0 |
| RIA BAO | 1 | 1 | 1 | 0 | 0 |
| WARAWATUNG | 0 | 2 | 0 | 1 | 0 |
| WUAKERONG | 2 | 0 | 0 | 0 | 1 |
| ATAWAI | 0 | 1 | 0 | 1 | 0 |
| ATAWUWUR | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| LIWULAGANG | 0 | 1 | 0 | 0 | 1 |
| LUSIDUAWUTUN | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
Sejumlah desa/kelurahan di Kec. Naga Wutung menjadi pusat pendidikan dengan jumlah sekolah yang lebih banyak dibanding wilayah lainnya.. Misalnya:
JL. LOANG
Loang
Loang
Mingar
Tewaowutung
Baopukang