Kec. Kelimutu terus menunjukkan perkembangan yang positif di bidang pendidikan. Dengan jumlah sekolah yang tersebar merata di berbagai desa dan kelurahan, wilayah ini berupaya memberikan akses pendidikan yang lebih baik untuk seluruh warganya. Berbagai pilihan jenjang pendidikan tersedia, mulai dari tingkat dasar hingga menengah, guna memenuhi kebutuhan masyarakat di Kec. Kelimutu.
DETUENA
Detubu
Woloara
Koanara
Nduaria
Nuamuri
Pemo
Waturaka
KOPOBHOBHE
| Nama Kelurahan | Negeri | Swasta | Akreditasi A | Akreditasi B | Akreditasi C |
|---|---|---|---|---|---|
| WOLOARA | 3 | 2 | 0 | 2 | 1 |
| KOANARA | 0 | 4 | 0 | 1 | 0 |
| NUAMURI | 0 | 3 | 0 | 0 | 3 |
| DETUENA | 2 | 0 | 0 | 0 | 1 |
| NDUARIA | 0 | 2 | 0 | 1 | 0 |
| NUAMURI BARAT | 2 | 0 | 0 | 1 | 1 |
| WATURAKA | 0 | 2 | 0 | 0 | 0 |
| PEMO | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
Sejumlah desa/kelurahan di Kec. Kelimutu menjadi pusat pendidikan dengan jumlah sekolah yang lebih banyak dibanding wilayah lainnya.. Misalnya:
Woloara
Woloara
Jl. Ende-Maumere
KOANARA
Moni